剑麻叶绿体基因组编码序列密码子的使用特征
2018-12-14龙凌云王丽萍覃剑峰危丹妮蔡中全
福建农林大学学报(自然科学版) 2018年6期
关键词:分析
金 刚, 覃 旭, 龙凌云, 王丽萍, 覃剑峰, 危丹妮, 陈 涛, 蔡中全
(1.广西壮族自治区亚热带作物研究所,广西 南宁 530001;2.广西大学农学院,广西 南宁 530004)
生物体遗传密码的功能完整性是由同义密码子维持的,它提供了基因表达和蛋白质进化之间的联系[1].大量研究表明,不同物种、同一物种的不同基因在同义密码子的使用偏好性上存在较大差异[2].这种偏好性保证了最优密码子可以与丰度最大的tRNA基因的反密码子配对.虽然同义密码子使用偏好对蛋白质序列没有直接影响,但由于密码子使用偏好已被证明是一种重要的进化力量,因此它可能影响蛋白质产物和细胞过程[3].
在植物分子进化研究中,叶绿体基因组因分子量较小、拷贝数较多且许多基因的功能已被注释而备受生物学家重视[4].叶绿体基因组中的翻译过程与单细胞生物相似,表明其同义密码子的使用可能与大肠杆菌相同[5].完整的叶绿体基因组可以为认识进化和自然选择提供机理性的启示,并已在认知物种和叶绿体进化机制上做出重大贡献[6].
剑麻又名龙舌兰麻,是龙舌兰科(Agavaceae)所属单子叶植物的统称.龙舌兰属是该科中最有经济价值的一个属,包含257个种,被广泛应用于纤维加工、酿酒、观赏等领域.东非坦桑尼亚剑麻试验站于1935—1957年将蓝剑麻与假菠萝麻杂交,并从回交后代中选育出了高产且抗寒性好的龙舌兰栽培种H.11648.其生命周期可产叶560~600片,出纤率高且叶缘无刺,现被广泛种植于……
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