广西北部湾地区猪圆环病毒2型检测及其ORF2遗传变异分析
2018-09-10吕其壮曹伟伟李佩伦莫昭展
吕其壮,刘 娟,陈 艳,刘 畅,颜 秋,曹伟伟,李佩伦,莫昭展
(1.玉林师范学院生物与制药学院,玉林 537000;2.广西农产资源化学与生物技术重点实验,玉林 537000;3.玉林师范学院商学院,玉林 537000;4.河南省动物疫病预防控制中心,郑州450000;5.玉林市动物疫病预防控制中心,玉林537000)
猪圆环病毒病(porcine circovirus associated disease,PCVAD)是由猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)引起的一种猪传染病或猪相关疾病的综合征,主要包括断奶仔猪多系统衰竭综合征、仔猪先天性震颤、成年猪皮炎肾炎综合征、增生性坏死性肺炎、肠炎、繁殖障碍和呼吸道疾病综合征[1]。该病于1991年首次发现于加拿大,现已呈全世界流行,死亡率介于10%~30%,个别猪场在暴发本病时死淘率高达40%左右[2]。我国于2000年首次报道该病的发生,迄今已经在我国猪群中普遍存在,严重阻碍了我国养猪业的发展[3,4]。
PCV2属于圆环病毒科(Circoviridae)圆环病毒属(Circovirus),其基因组是一条共价结合形成的闭合环状的单链DNA,大小为1766~1768 bp,编码11个潜在开放阅读框(open reading frame,ORF)[3]。PCV2各毒株的核苷酸序列同源性都在90%以上,分为PCV2a、PCV2b、PCV2c、PCV2d和PCV2e 5种基因亚型,其中PCV2b是目前PCV2最主要的流行毒株[5]。PCV2 ORF2 基因序列较短且拥有较少的labor-extensive序列,其编码的Cap蛋白不仅是病毒主要结构蛋白或衣壳蛋白,而且是PCV2全基因组中变异程度最高的蛋白,Cap的多态性既在病毒吸附过程中起重要作用,又影响病毒装配动力学和结构稳定性,因此ORF2基因经常被认为是引起PCV2整个基因组变异的主要靶基因[3,6]。
本研究采用PCR方法对2016年采自广西北部湾地区疑似PCV2感染的猪病料样品进行PCV2检测并对分离株的ORF2基因进行扩增、克隆、测序和序列进化分析,以探讨该区域近期PCV2的分子流行病学变异趋势和变异规律,进而为PCVAD的分子诊断和免疫预防等研究提供一定的理论依据。……
