邱丹腾, 张海玲, 陈玲琳, 潘超逸, 陈姗姗, 饶平凡, 刘树滔

(1.福州大学生物工程研究所, 福建 福州　350002； 2.中国科学院上海生命科学研究院, 浙江工商大学食品营养科学联合研究中心, 浙江 杭州　310035)

0　引言

肠道菌群是目前生命科学的一个研究热点, 与人体营养与健康有着密不可分的互惠共生关系.随着现代分子生物学技术的成熟[1-4], 下一代测序技术的不断进展以及价格不断下降[5-6], 大量宏基因组研究产生的海量测序数据, 使不依赖于培养而进行复杂且多样的微生物群落研究成为可能.然而, 无论是现有的分子生物学技术还是高通量测序技术各自在某些方面仍不甚完善, 有一些问题亟待解决[7-8].其中最关键的问题是, 这些方法都是对待测样品中的DNA分子进行分析, 所以具备理想的纯度、 浓度和完整性样品的总DNA的提取是研究的前提和关键.另外, 这两大类分析技术都无法回收细菌细胞进行生理生化分析, 从而进一步确认某种细菌的存在及其特性.如果能找到类似差异显示PCR技术[9]的方法, 预先将肠道菌群样品分成多个组分, 再分别提取DNA, 从而提高DNA的浓度和纯度, 有望提高较低丰度细菌的DNA提取效率, 保证肠道微生物结构多样性及其丰度的检测结果的完整性和准确性.

高效液相色谱技术是微生物分离、 分析和制备方法的一种创新选择.细菌作为带电颗粒, 不同pH环境下其细胞表面带有许多不同的电荷, 可以像生物大分子一样, 利用离子交……