许瑞瑞，李睿，王小非，郝玉金



苹果OFP基因家族的全基因组鉴定与非生物逆境表达分析

许瑞瑞1,2，李睿2，王小非2，郝玉金2

（1潍坊学院生物与农业工程学院/山东省高校生物化学与分子生物学重点实验室，山东潍坊 261061；2山东农业大学园艺科学与工程学院/ 国家苹果工程技术研究中心，山东泰安 271018）

【目的】从苹果全基因组中鉴定OFP（OVATE family protein）家族蛋白成员，对其进行基因结构特征、组织表达及非生物逆境等系统分析，为研究苹果的潜在功能提供理论基础。【方法】利用生物信息学手段，在苹果基因组数据库中筛选鉴定OFP基因家族成员；利用MEGA5.0软件进行系统进化树分析；通过MapDraw和GSDS等生物信息学工具分析基因结构及染色体定位；根据已有的苹果芯片数据库结果进行OFP基因表达谱分析；利用实时荧光定量PCR技术检测13个的组织表达和诱导表达情况。【结果】苹果OFP基因家族包含28个成员，根据系统进化关系将其分为4组，分别包含13、6、4和5个成员；苹果中13条染色体上均有OFP基因分布，其中第12条染色体最多，有6个成员，该基因家族的分布具有广泛性；芯片表达谱分析结果表明该类基因家族在花、果实和叶中的表达量较高，qRT-PCR验证结果较一致；经NaCl和PEG处理后，苹果根部与地上部呈现出不同程度的响应差异，NaCl处理明显诱导两组织中和的表达，、和的表达在根部与地上部组织则相反；温度胁迫明显影响的表达量，其中和经高温和低温胁迫处理后均明显上调。【结论】苹果OFP基因家族共有28个成员，分布于13条染色体上，该家族成员呈现出不同的组织表达模式和胁迫响应模式。……