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研究表明，分枝杆菌起源于1.5亿年以前[1]。结核病(Tuberculosis，TB)是由结核分枝杆菌复合群(Mycobacteriumtuberculosiscomplex，MTBC)感染引起的一种慢性人兽共患传染病，MTBC主要包括结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis)、非洲分枝杆菌(Mycobacterium.africanum) 、卡氏分枝杆菌(Mycobacterium.canetti) 、牛分枝杆菌(Mycobacterium.bovis)、田鼠型结核杆菌(Mycobacterium.microti)和卡介苗(Bacillus Calmette-Guérin , BCG)[2]。早在1882年，德国细菌学家柯赫(Robert Koch)就已证明结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis，MTB)是结核病的病原菌[1]。Cole等[3]于1998年完成了对结核分枝杆菌 H37Rv全基因组测序，H37Rv基因组包含4 411 529个碱基对，约含4 000个基因，并且具有非常高的鸟嘌呤和胞嘧啶含量,与其他细菌的基因组相比，结核分枝杆菌基因组上存在很大一部分基因编码参与脂肪生成和脂肪分解的酶、以及两个富含甘氨酸的蛋白质家族，具有免疫学意义，可能是潜在的多态性抗原。随着比较基因组学技术的发展，通过全基因组比对研究发现，结核分枝杆菌复合群中不同种细菌(如结核分枝杆菌、牛分枝杆菌或卡介苗)的基因组中存在一些缺失片段，这些缺失片段被称为差异区域(Region of Differences，RD)，通称为RD区。研究显示，RD区基因与结核分枝杆菌的毒力密切相关，且这些基因的功能在结核病新型疫苗研发及新型诊断方法建立中具有重要的潜在意义及应用价值[4]。本文主要综述结核分枝杆菌基因组RD区及其编码蛋白的研究进展。

1 RD区概述

通过人造细菌染色体(Bacterial Artificial Chromosome，BAC)数据库和比较基因组学等方法，发现结核分枝杆菌复合群基因组中共有16 个RD区，即RD1-RD16，含有129个开放阅读框,如表1所示。在不同的BCG 亚株和非结核分枝杆菌中缺失的片段又有所不同[5-6]。

表1 结……