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结直肠腺瘤基因低甲基化谱分析及其标记物的筛选研究*

2018-03-09何纯刚黄沁园钟世彪陈利生肖和卫

结直肠肛门外科 2018年1期
关键词:差异分析

何纯刚 黄沁园 钟世彪 陈利生 肖和卫 李 雷

(1广西壮族自治区人民医院 广西南宁 530021;2广西医科大学护理学院 广西南宁 530021;3广西壮族自治区民族医院 广西南宁 530021;4广西医科大学第一附属医院 广西南宁 530021)

目前公认“正常黏膜—结直肠腺瘤—结直肠癌”是散发性结直肠癌的发病机制之一,甲基化(包括高甲基化及低甲基化)是肿瘤中表观遗传学改变最常见的类型之一,目前研究最深入的是抑癌基因启动子甲基化的研究,但关于基因低甲基化在结直肠腺瘤中的作用机制尚未完全明确。因此,本研究采用全基因组甲基化芯片分析结直肠腺瘤低甲基化谱,并寻找基因低甲基化标记物,为进一步研究结直肠腺瘤发生发展的分子机制及早期诊断提供依据,现报告如下。

1 资料与方法

1.1 研究对象 本研究中,组织标本源自2013年1月至2014年12月于广西医科大学第一附属医院结直肠肛门外科及广西壮族自治区人民医院住院患者,共收集29例标本:包括9例内镜下切除的结直肠腺瘤标本(直径≥2 cm)及20例结直肠黏膜标本(经肠镜排除炎症性肠疾病、癌前病变及癌)作正常对照组。在9例腺瘤患者中男性4例,女性5例,中位年龄53岁;部位:结肠7例,直肠2例;病理类型:绒毛状腺瘤2例,管状绒毛状腺瘤3例,管状腺瘤4例,均无癌变。收集的标本直接放入-80℃冰箱中保存。本研究收集标本已获得患者同意,研究获得广西壮族自治区人民医院伦理委员会批准。

1.2 DNA提取及亚硫酸氢盐修饰转化 组织DNA的提……

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