土壤中存在着地球上最多样化的微生物群落，它们对地球养分循环和碳储存都至关重要。为了更好的了解土壤功能，对土壤微生物的全球分布模式和功能基因序列进行建模，并了解土壤中细菌和真菌群落的多样性和结构之间的生物、环境联系是很有必要的。

本文通过利用宏基因组学和DNA宏条形码技术对全球的表层土壤样本（189个取样点、7560个样本）进行检测发现在温带地区的细菌遗传多样性最为丰富，同时微生物基因的组成随环境变量的变化比随地理距离的变化更为显著。本文研究结果表明土壤中的真菌和细菌表现出全球生态的分化，这与它们对降水、土壤PH多样的差异性反应有关。此外，在表层土壤和海洋生境中存在着强烈的细菌-真菌拮抗作用，这一结论是从抗生素不敏感基因中推断而来的。这一结论说明生物间的相互作用在微生物群落形成过程中所起的重要作用。研究结果还表明竞争和环境过滤作用对细菌和真菌群落的丰度、组成和编码基因功能都有影响，说明这些微生物对全球养分循环的相对贡献存在着空间差异。

Mohammad Bahram, Falk Hildebrand, Sofia K. Forslund, Jennifer L. Anderson, Nadejda A. Soudzilovskaia, Peter M. Bodegom, Johan Bengtsson-Palme, Sten Anslan, Luis Pedro Coelho, Helery Harend, Jaime Huerta-Cepas,Marnix H. Medema, Mia R. Maltz, Sunil Mundra, Pål Axel Olsson, Mari Pent, Sergei Põlme, Shinichi Sunagawa, Martin Ryberg,Leho Tedersoo & Peer Bork

Nature 560, 233–237（Published:01 August 2018）