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先天性心脏病相关易感基因的预测性分析

2018-01-23程菲闫虹

中国医药指南 2018年8期
关键词:实验分析研究

程 菲 闫 虹

(沈阳市儿童医院,辽宁 沈阳 110034)

先天性心脏病是最常见的出生缺陷,占婴幼儿非感染性死亡原因首位[1-2],占主要的先天性畸形的1/3[3]。Denise等[3]统计,近15年中先天性心脏病的出生患病率最高达到9.1/1000。随着遗传学的发展和研究,发现先天性心脏病的产生与多个基因的相互作用密切相关。所以,对生物基因功能进行研究,破译基因的生物学功能并对其加以利用对先天性心脏病的临床诊断和治疗具有重要意义。因此,本文对针对多种基因相互作用的影响进行研究,采用预测性分析的方法对与先天性心脏病形成有关的基因进行分析采,以望能更加深入的了解先天性心脏病形成的原因,从而更好的对其进行预防和治疗。

1 材料与方法

1.1 一般材料:通过OMIM数据库获取28个已知的先天性心脏病相关易感基因,称为“种子基因”。在在人类蛋白质相关HPRD、BIOGRID、BIND的数据库中对人类蛋白质相互作用数据进行整合,获得9817个蛋白质互作网络。

1.2 分析蛋白质互作网络:将“种子基因”输入HPRD、BIOGRID 和BIND 数据库,检索获取已知的“种子基因”所对应蛋白质。研究人员将有关数据进行整理和统计,重点对“种子基因”以及对其产生重要影响的邻近基因进行研究和分析。运用统计学方法对这些基因所占的比例进行统计。同时,研究人员还将具有蛋白质相互作用信息的基因与对其产生直接影响的基因进行比例上的比较。在对数据进行统计与整理之后,研究人员根据真实数据对“种子基因”临近结点处是否有疾病相关的易感基因在此集聚进行判断分析。……

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