管维红

(江苏信息职业技术学院 物联网工程学院，江苏 无锡 214153)

蛋白质序列与蛋白质结构关系的研究

管维红

(江苏信息职业技术学院 物联网工程学院，江苏 无锡 214153)

蛋白质结构与功能的研究一直是分子生物学研究的热点之一.基于混沌理论对蛋白质序列特性进行研究，先将蛋白质序列转为时间序列，再对其进行相空间重构，通过计算确定时间延迟t、嵌入维数m等参数，最后计算得出蛋白质序列的最大Lyapunov指数，通过对蛋白质结构分类数据库SCOP中七类蛋白质结构的蛋白质序列最大Lyapunov指数计算和比较，发现蛋白质整体序列和蛋白质结构没有明显关联.

蛋白质序列；蛋白质结构；混沌；最大Lyapunov指数；关联

0 引言

分子生物学研究中还存在很多未解之谜，蛋白质结构和功能的研究还处在初始阶段，蛋白质结构和功能的预测一直是研究热点，其中蛋白质序列和蛋白质结构及功能之间是否存在某种关系也尚未明确[1].关于蛋白质序列的特性早期也曾有不少学者做过相关研究：有的认为蛋白质序列是随机的[2]，有的认为蛋白质序列具有分形特征[3]，笔者基于混沌理论并结合前人基础进行研究，给出蛋白质序列具有混沌特性的结论[4-5]，并且先后完善了蛋白质序列最大Lyapunov指数的计算方法.关于蛋白质序列与结构的关系，也有学者给出一些结论，有的采用功率谱的方法对不同结构类蛋白质序列进行研究，认为不同结构类蛋白质序列具有与它们的……