短期盐胁迫下盐穗木的转录组分析
2018-01-09张丽丽张富春
植物研究 2018年1期
张丽丽 张富春*
(1.新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐 830046; 2.新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐 830046)
短期盐胁迫下盐穗木的转录组分析
张丽丽1,2张富春1,2*
(1.新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐 830046;2.新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐 830046)
盐穗木(Halostachyscaspica)是荒漠盐碱地广泛分布的盐生植物,具有极强的耐盐性。为揭示盐胁迫下盐穗木基因组层面的基因表达变化特性,通过对300和500 mmol·L-1NaCl胁迫3 h的盐穗木同化枝进行了转录组测序。有效序列组装共得到153 298条平均长度为643 bp的unigenes,进行GO和KEGG功能聚类,分别获得47个GO功能小类和118个KEGG通路。差异表达基因分析显示,短期低盐(300 mmol·L-1)响应基因有4 432个,高盐(500 mmol·L-1)响应基因有2 580个,两个胁迫的共差异基因有1 245个,主要富集在细胞过程、代谢过程和响应刺激等类别中。从短期盐胁迫下盐穗木转录组筛选出渗透调节和活性氧清除的相关基因,大多为上调基因。说明盐穗木能够通过促进渗透调节和增强活性氧清除提高短期的盐胁迫适应能力。
盐穗木;盐胁迫;转录组;差异基因;渗透调节;活性氧
土壤盐渍化不仅是导致生态环境恶化的主要原因,同时也是世界范围内影响农作物生产的主要非生物胁迫因素之一[1]。高浓度的盐会对植物产生包括渗透胁迫、氧化胁迫和离子毒害等的次级伤害,严重地影响了农作物的产量和品质。新疆作为中国最大的盐碱土分布区域,土壤盐渍化面积高达11万km2,占新疆总面积的7%[2],但在新疆荒漠盐碱环境……
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