文/本刊记者 王瑞平

凭借最新技术满足用户需求获取蛋白质组学的最优解

文/本刊记者 王瑞平

图1 SCIEX中国区总经理邵红

SWATH技术是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold博士及其团队与SCIEX于2012年联合推出的一项全新的质谱采集模式技术，是MS-MSALL技术的一种扩展，与传统的shot-gun技术相比，SWATH采集模式能够将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂，获得完整肽段信息。同时，借助先进的Triple-TOF5600 plus质谱系统，SWATH在定量上具有较高准确度和动态范围。基于SWATH技术的定量方法能够直接构建二级碎片离子的XIC，大大增加定量的准确度和可重现性。为进一步了解该技术在蛋白质组学领域的成功应用与未来的发展方向，本刊记者有幸采访到SCIEX中国区总经理邵宏，请她就上述问题做出进一步解读。

SWATH技术的独特优势

SWATH技术具有采集数据完整、重复性高、简单易行、定量精确等优势。作为一种数据非依赖性采集技术（Data Independent Acquisition，DIA），SWATH将质谱扫描范围分为若干个连续窗口，然后，采集每个窗口中的所有碎片离子，从而获取完整数据，实现在一次实验里对所有化合物的定性和定量。SWATH技术的全面数据采集，克服传统数据依赖型采集技术（Data Dependent Acquisition，DDA）中数据的不完整、重复性差等缺点。此外，SWATH和MRM技术类似，通过多个二级质谱碎片离子进行定量，因而，具备MRM定量级别的准确性和重复性。SWATH技术的创新和优势，完全凭借SCIEX Triple TOF高分辨质谱超高采集速度、高分辨率和高灵敏度性能得以实现。近些年，Triple TOF强大的性能得以进一步发挥，通过多窗口采集和可变窗口采集，减少每个窗口中同时采集离子的复杂度，降低数据解析时的难度与错误率，进一步推出SWATH2.0技术。……