库尔勒香梨PsLOX基因克隆及生物信息学分析
2017-12-22刘旭新徐立生吐尔逊娜依
张 军 刘旭新 徐立生 吐尔逊娜依 李 疆
(1.新疆农业职业技术学院园林科技学院,昌吉 831100; 2.新疆喀什质量技术监督局,喀什 844000; 3.新疆农业大学林学与园艺学院,乌鲁木齐 830052)
库尔勒香梨PsLOX基因克隆及生物信息学分析
张 军1刘旭新1徐立生2吐尔逊娜依1李 疆3*
(1.新疆农业职业技术学院园林科技学院,昌吉 831100;2.新疆喀什质量技术监督局,喀什 844000;3.新疆农业大学林学与园艺学院,乌鲁木齐 830052)
克隆了库尔勒香梨(PyrussinkiangensisYü)脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)基因PsLOX,了解其在香梨果实不同发育时期的表达差异,为香梨果实香气代谢机理研究提供理论依据。以库尔勒香梨嫩叶及不同时期果实表皮为试材,利用两种不同的方法提取总RNA,通过RT-PCR技术得到目的基因PsLOX的cDNA序列,以生物信息学方法对其进行分析和功能预测。运用半定量RT-PCR(SqRT-PCR)技术,分析PsLOX基因在香梨嫩叶及果实生长发育及货架期的表达特性和差异。结果:试剂盒提取总RNA质量较高,PsLOX基因CDS序列为912 bp,编码303个氨基酸,属于脂氧合酶家族基因,与其他植物LOX基因编码的氨基酸序列有较高的同源性,与南果梨相似性最高,达到99%;PsLOX基因在香梨果实中发育过程中表达差异明显,即生长发育前期表达量很低,成熟至完熟时期表达量最高,然后开始减少。推测克隆获得PsLOX基因在香梨果实香气代谢过程中起到重要作用。
库尔勒香梨;PsLOX基因;半定量RT-PCR;香气
果实香气是一类由大量挥发性芳香物质组成的复杂混合物,能够反映出果实的风味特点,是评价果实品质的重要指标[1~2]。库尔勒香梨(PyrussinkiangensisYü. cv.‘Kuerle xiangli’)属于新疆特有梨种,果实以独特而浓郁的芳香气味而著称[3]。……
