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甜高粱WRKY转录因子基因的克隆与表达分析

2017-12-01胡小文姚艳丽邢淑莲

西南农业学报 2017年11期

徐 磊,胡小文,姚艳丽,邢淑莲,刘 洋

(中国热带农业科学院湛江实验站 广东省旱作节水农业工程技术研究中心,广东 湛江 524013)

甜高粱WRKY转录因子基因的克隆与表达分析

徐 磊,胡小文,姚艳丽,邢淑莲,刘 洋*

(中国热带农业科学院湛江实验站 广东省旱作节水农业工程技术研究中心,广东 湛江 524013)

【目的】克隆甜高粱WRKY基因,分析其序列特征和表达谱,为甜高粱抗旱育种提供基因来源。【方法】以甜高粱品种M81-E幼苗总RNA为模板,利用RT-PCR技术克隆甜高粱WRKY基因,通过生物信息学软件分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR检测基因表达情况,获得2条WRKY基因,命名为SbWRKY1(Genebank 登录号:KY231904)和SbWRKY2(Genebank 登录号:KY231905)。【结果】SbWRKY1 cDNA序列全长1086 bp,包括1个1059 bp的开放阅读框,编码352个氨基酸。SbWRKY2 cDNA序列全长750 bp,包括1个717 bp的开放阅读框,编码238个氨基酸。2个基因编码的蛋白均具有WRKY核心序列“WRKYGQK”和“C-X4-5-C-X22-23 -H-X1-H”锌指结构模型。SbWRKY1蛋白分子式为C1628H2619N509O504S16,预测蛋白质分子量为37.89 kDa,等电点(PI)为9.78。SbWRKY2蛋白分子式为C1131H1752N326O344S21,预测蛋白质分子量为26.09 kDa,等电点(PI)为8.43。系统进化树分析表明,SbWRKY1蛋白与高粱、玉米和谷子WRKY蛋白亲缘关系较近,SbWRKY2蛋白与高粱、芒草和玉米WRKY蛋白亲缘关系较近。荧光定量PCR分析表明,随着干旱胁迫时间延长,SbWRKY1和SbWRKY2呈上调表达趋势。【结论】SbWRKY1和SbWRKY2基因可能在甜高粱应对干旱胁迫中发挥一定作用。

甜高粱;转录因子;WRKY;RT-PCR

【研究意义】转录因子(transcription factor)又称反式作用因子,它能激活或抑制相关基因表达,通过这一转录调控过程,植物可以应对各种生物及非生物胁迫[1]。根据转录因子DNA保守结构域的特点,可以将其分成若干个家族,如AP2/EREBP、MADS、bZIP和MYB等[2]。……

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