刘国红,刘 波,王阶平,朱育菁,车建美,陈倩倩,陈 峥

福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003

养猪微生物发酵床芽胞杆菌空间分布多样性

刘国红,刘 波*,王阶平,朱育菁,车建美,陈倩倩,陈 峥

福建省农业科学院农业生物资源研究所, 福州 350003

了解微生物发酵床大栏养猪垫料中的芽胞杆菌多样性和空间分布规律,为微生物发酵床管理、芽胞杆菌新资源挖掘及菌剂开发奠定基础。将发酵床划分为32个方格(4行 × 8列),采用五点取样法获得每个方格的样品。采用可培养法从32份样品中分离芽胞杆菌菌株,利用16S rRNA基因序列初步鉴定所分离获得的芽胞杆菌种类。利用聚集度指标和回归分析法,分析芽胞杆菌的样方空间分布型。通过Shannon-Wiener多样性指数、Simpson优势度指数、Hill指数及丰富度指数分析,揭示微生物发酵床中芽胞杆菌的空间分布多样性。从32份样品中共获得芽胞杆菌452株,16S rRNA基因鉴定结果表明它们分别隶属于芽胞杆菌纲的2个科、8个属、48个种。其中,种类最多的为芽胞杆菌属(Bacillus),30种；赖氨酸芽胞杆菌属(Lysinibacillus),6种；类芽胞杆菌属(Paenibacillus),5种；短芽胞杆菌属(Brevibacillus),3种；鸟氨酸芽胞杆菌属(Ornithinibacillus)、大洋芽胞杆菌属(Oceanibacillus)、少盐芽胞杆菌属(Paucisalibacillus)和纤细芽胞杆菌属(Gracilibacillus)各1个种。芽胞杆菌种类在发酵床空间分布差异很大,根据其空间出现频次,可分为广分布种类,如地衣芽胞杆菌(Bacilluslicheniformis)；寡分布种类,如根际芽胞杆菌(B.rhizosphaerae)；少分布种类,如弯曲芽胞杆菌(B.flexus)。依据其数量,可分为高含量组优势种群,如地衣芽胞杆菌(B.licheniformis)；中含量组常见种群,耐盐赖氨酸芽胞杆菌(Lysinibacillushalotolerans)；……