屈泰龙，李润成，罗斌宇，葛 猛，严美君，胡辉灿，余兴龙

(湖南农业大学 动物医学院，湖南 长沙 410128)

湖南省健康猪群中不同基因型猪博卡病毒流行性及进化分析

屈泰龙，李润成，罗斌宇，葛 猛，严美君，胡辉灿，余兴龙

(湖南农业大学 动物医学院，湖南 长沙 410128)

为了解猪博卡病毒在不同年龄健康猪群中的感染情况，通过对GenBank登录的猪博卡病毒基因序列分析设计2对引物可分别扩增PBoV1/2的部分NS1基因和PBoV3/4/5的部分VP1基因。提取2016年8-12月收集自湖南5个集约化猪场2～20周龄猪共430份肛门拭子样品的DNA并进行PCR检测。PBoV阳性率为64.6%(278/430)，PBoV1/2阳性率为27.2%(117/430)，PBoV3/4/5阳性率为45.1%(194/430)，混合感染率为7.7%(33/430)，PBoV3/4/5阳性率显著高于PBoV1/2阳性率(P=0.034)。PBoV1/2在 2～10周检出率高于其他周龄，但是与其他周龄猪体内检出率统计分析无显著性差异，PBoV3/4/5主要感染8～16周猪，与4周以内猪差异显著，与其他猪群差异不显著。对各型的核苷酸与参考序列核苷酸相似性分析显示PBoV1/2之间的平均相似度为85.4%，PBoV3/4/5之间的平均相似度为67.2%。PBoV在健康猪群中流行广泛且存在共同感染现象，对猪的健康尤其是肠道微生物平衡可能存在潜在影响。

猪博卡病毒；流行性；进化分析；混合感染；致病性

猪博卡病毒(Porcinebocavirus， PBoV)属于细小病毒科博卡病毒属，主要感染猪，2009年首次从患有仔猪断奶后多系统衰竭综合征的仔猪体内鉴定[1]。随后，在许多国家均有报道猪群受该病毒感染，并获得了全基因组或者部分基因[2-4]。根据碱基相似性将PBoV分为5个基因型，通过基因差异设计了引物用于PCR检测，加快了该病毒的流行病学调查[5-6]。……