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低温胁迫下杜鹃杂交后代优良株系的转录组分析

2017-11-04吴月燕何静雯沈梓力吴燕燕谢晓鸿

华北农学报 2017年5期
关键词:数据库功能分析

吴月燕,明 萌,2,何静雯,2,卢 丹,沈梓力,邱 甜,吴燕燕,谢晓鸿

(1.浙江万里学院 生物与环境学院,浙江 宁波 315100;2.上海海洋大学 水产与生命学院,上海 201306)

低温胁迫下杜鹃杂交后代优良株系的转录组分析

吴月燕1,明 萌1,2,何静雯1,2,卢 丹1,沈梓力1,邱 甜1,吴燕燕1,谢晓鸿1

(1.浙江万里学院 生物与环境学院,浙江 宁波 315100;2.上海海洋大学 水产与生命学院,上海 201306)

为探索杜鹃抗寒的分子机制,筛选抗寒相关基因,利用人工模拟低温,以杜鹃杂交后代优良株系繁景-6 ℃(T)处理和25 ℃(CK)对照为试验材料,进行转录组测序和数据从头组装及生物信息学分析,通过组装得到 Unigenes序列122 654个,功能注释结果显示,有大量Unigenes可以注释到基因本体(GO)和蛋白质直系同源数据库(COG) 等数据库上,部分Unigenes无匹配信息,可能为杜鹃特有的基因序列。按GO功能分类,繁景杜鹃中的 Unigenes分为细胞组分、分子功能以及生物学过程3类,包括51个分支,其中有大量的Unigenes与代谢进程、催化活性和细胞进程相关。上调差异表达基因有6 347个,下调差异表达基因4 482个。通过对转录结果中差异表达显著的4个转录因子家族中的24个基因,其中,上调12个,下调12个,在低温胁迫下的表达水平验证,发现其与转录结果基本一致,证明该转录组数据可靠。

杜鹃;低温胁迫;转录组;抗寒基因

杜鹃花(Rhododendron),是杜鹃花科(Ericaceae)杜鹃花属(RhododendronL.)多种植物的总称,又称山踯躅、山石榴、映山红,是常绿或落叶灌木[1-2],为浙江省重要的绿化植物。但由于受气候条件等影响,只能用品种较单一,花色较为单调,花期大多在4-5月中下旬较为耐寒的杜鹃品种。……

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