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MiR-148a-3p靶基因的预测与验证

2017-11-02唐雪梅彭小宁

湖南师范大学学报(医学版) 2017年6期

唐雪梅,彭小宁

(湖南师范大学医学院,长沙 410013)

MiR-148a-3p靶基因的预测与验证

唐雪梅,彭小宁

(湖南师范大学医学院,长沙 410013)

目的:预测和验证miR-148a-3p的靶基因。方法:利用生物信息学方法预测miR-148a-3p的靶基因;在神经胶质瘤细胞U87/U251中建立miR-148a过表达及抑制表达稳定细胞系。利用qPCR实验验证miR-148a-3p与靶基因的靶向关系;利用Western Blot实验检测靶蛋白表达水平。结果:生物信息学方法预测结果显示dynein light chain LC8-type 2(DYNLL2)为miR-148a-3p靶基因之一;qPCR实验结果显示DYNLL2在神经胶质细胞HA1800与神经胶质瘤细胞U87/U251中的表达有差异,在神经胶质瘤细胞miR-148a过表达及抑制表达的细胞中表达有差异;Western Blot实验结果显示DYNLL2的蛋白表达水平在神经胶质细胞HA1800与胶质瘤细胞U87/U251中有差异。结论:miR-148a-3p与DYNLL2有确切的靶向关系,DYNLL2在神经胶质细胞与胶质瘤细胞中均有表达,与正常胶质细胞相比,DYNLL2在神经胶质瘤细胞中表达下调,包括基因水平和蛋白水平,miR-148a-3p能够负向调控DYNLL2的表达。

微小RNA;miR-148a-3p;DYNLL2

微小RNA(microRNA,miRNA)是一类长度为18~24个核苷酸的内源性非编码小分子单链RNA。通过完全或不完全互补结合靶mRNA3’UTR,在转录后水平上对靶基因表达水平进行调控。有研究表明多种miRNAs参与调控神经胶质瘤的发生发展,其中包括高表达的mir-148a[1]。本课题组前期研究发现,在神经胶质母瘤组织及细胞中miR-148a-3p的表达水平明显高于正常神经胶质组织及细胞,mir-148a在神经胶质母细胞瘤中作为负性风险因子存在,高表达的mir-148a促进胶质母细胞瘤的恶性化进程的演变,且与胶质母细胞瘤患者生存率呈负向相关性。寻找mir-148a-3p的靶基因能够深入揭示mir-148a-3p在神经胶质母细胞瘤发病中的调控机制。……

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