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Netrin蛋白家族的进化分析

2017-10-13陈丹丹刘阿克邹央云

复旦学报(自然科学版) 2017年1期
关键词:功能检测模型

陈丹丹,张 朝,刘阿克,邹央云,谷 迅

(复旦大学 生命科学学院,上海 200438)

Netrin蛋白家族的进化分析

陈丹丹,张 朝,刘阿克,邹央云,谷 迅

(复旦大学 生命科学学院,上海 200438)

神经突起生长导向因子(Netrin)蛋白家族是分泌型蛋白质,其通过与不同的受体相互作用,在神经发育过程中起轴突导向和细胞迁移中发挥着双重导向功能.本文分别对涉及到细胞相互作用的Netrin基因家族的起源与进化进行研究.以进化史不同阶段的代表物种作为研究对象,通过使用MEGA的邻接法和似释然法分别对Netrin基因家族构建系统发育树;使用PAML 4.7工具以核苷酸序列作为分析材料进行选择压分析,筛选出发生正选择作用的位点;使用DIVERGE3.0软件对Netrin氨基酸序列进行功能分化分析,筛选出Ⅰ型和Ⅱ型功能分化位点.

Netrin; 基因家族; 功能分化; 选择压力; 细胞黏连

癌症是一个进化过程的产物,突变在细胞内不断积累到一定程度会使细胞转变成恶性肿瘤.转移特性是恶性肿瘤特有的特性之一,这个特性为肿瘤细胞转移到身体其他组织提供条件,使得肿瘤细胞可以扩散到临近的组织或者通过血液、淋巴系统等到达身体其他部位,浸润目的组织,形成新的病灶.细胞通过解除与其他细胞之间的吸附作用,这个从原发病灶解吸附的过程是转移过程的前提条件,这个过程涉及到与细胞吸附有关的蛋白质的分泌,因此对这些基因的进化机制的研究具有一定的意义.

神经突起生长导向因子(Netrin)是一组具有……

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