贾瑞瑞，周鹏飞，白晓晶，陈善春，许兰珍，彭爱红，雷天刚，姚利晓，陈敏，何永睿，李强



柑橘响应溃疡病菌转录因子CsBZIP40的克隆及功能分析

贾瑞瑞，周鹏飞，白晓晶，陈善春，许兰珍，彭爱红，雷天刚，姚利晓，陈敏，何永睿，李强

（西南大学柑桔研究所/中国农业科学院柑桔研究所/国家柑桔工程技术研究中心，重庆400712）

【目的】分析柑橘BZIP转录因子家族并克隆柑橘溃疡病菌相关的转录因子CsBZIP40，对其进行亚细胞定位并研究外源激素及机械损伤对该基因的诱导表达，确定其诱导表达模式，分析其与溃疡病菌侵染的关系。【方法】基于全基因组公共数据库，对柑橘BZIP转录因子进行综合专业注释以获得柑橘中BZIP家族的所有成员信息，并根据染色体定位对其进行命名；利用MEME分析其结构域；利用MEGA 6.0分析柑橘BZIP与拟南芥BZIP的系统发育关系，并根据系统发育关系对该基因家族进行分类，确定本研究关注的CsBZIP40所属的类型；结合染色体定位和系统发育树确定该家族的基因复制情况；利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法验证感染溃疡病菌前后由柑橘转录组筛选出的表达模式；分析、启动子元件（plantCARE）和核定位信号（cNLSmapper），构建GFP融合载体，用洋葱表皮进行亚细胞定位分析，来对预测的核定位信息进行验证；利用qRT-PCR技术分析水杨酸（SA）、茉莉酸甲酯（MeJA）、乙烯利（ET）以及机械损伤（wounding）对该基因的诱导表达模式，揭示该转录因子与激素代谢途径的关系。【结果】从柑橘（甜橙）全基因组数据库中共注释到47个，这些基因位于9号染色体之外的所有染色体上，其中3号染色体基因密度最大为4.5×10-7个/Mb，2号染色体上的基因密度最小，仅占所有基因的2%；……