中华蜜蜂幼虫肠道的高表达基因分析
2017-09-27解彦玲王鸿权侯志贤江亮亮熊翠玲郑燕珍徐细建黄枳腱陈大福
解彦玲,王鸿权,张 璐,侯志贤,刀 晨,江亮亮,熊翠玲,郑燕珍,徐细建,黄枳腱,郭 睿,陈大福
(福建农林大学 蜂学学院,福建 福州 350002)
中华蜜蜂幼虫肠道的高表达基因分析
解彦玲,王鸿权,张 璐,侯志贤,刀 晨,江亮亮,熊翠玲,郑燕珍,徐细建,黄枳腱,郭 睿*,陈大福
(福建农林大学 蜂学学院,福建 福州 350002)
中华蜜蜂(中蜂)是中国特有的本土蜜蜂资源,也是养蜂生产中的常用蜂种之一,具有重要的生态和经济价值。本研究利用RNA-seq技术对中蜂5和6日龄幼虫肠道进行深度测序,得到的有效读段(clean reads)数分别为29290630与26636038,Q20分别为98.45%和98.38%。GO富集分析结果显示,Ac5中的高表达基因(HEGs)富集在44个GO term,其中基因富集数最多的为代谢进程(753 unigenes),其次是催化活性(679 unigenes)与结合(657 unigenes);Ac6中的HEGs富集在44个GO term,其中基因富集数最多的为代谢进程(792 unigenes),其次是结合(760 unigenes)和催化活性(744 unigenes)。KEGG代谢通路(pathway)富集分析结果显示,Ac5的HEGs富集在129个pathway,其中基因富集数最多的是核糖体(103 unigenes)、内质网蛋白质加工(68 unigenes)和碳代谢(67 unigenes);Ac6的HEGs富集在129个代谢通路,其中基因富集数最多的是核糖体(103 unigenes)、氧化磷酸化(88 unigenes)及内质网蛋白质加工(68 unigenes)。进一步对HEGs进行Venn分析,结果显示,二者共有的HEGs为2 015个,特有的HEGs分别为219和491个。研究结果不仅可提供中蜂幼虫肠道发育过程中的基因表达谱数据,也为分子水平上深入研究中蜂幼虫肠道发育提供重要信息。
RNA-seq;中华蜜蜂;幼虫肠道;高表达基因
东方蜜蜂(Apiscerana)主要集中分布于亚洲的中国、日本、泰国、菲律宾和伊朗等国家,以及俄罗斯远东地区[1]。中华蜜蜂(Apisceranacerana,简称中蜂)特指分布在我国的东方蜜蜂,其距今已有3 000多年的驯养历史[2]。……
