李鹏飞，冯 将，刘 嫒，包细明，张 益，李 婷，鲜思美,2(.贵州大学 动物科学学院，贵阳 550025；2.贵州省动物疫病研究所，贵阳 550025)

羊口疮病毒重庆株 F1L基因克隆与生物信息学分析

李鹏飞1，冯 将1，刘 嫒1，包细明1，张 益1，李 婷1，鲜思美1,2
(1.贵州大学 动物科学学院，贵阳 550025；2.贵州省动物疫病研究所，贵阳 550025)

旨在分析OrfV-CQ株 F1L基因的分子特点，预测其编码蛋白的生物学功能。对OrfV-CQ株 F1L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定，利用生物信息学相关软件进行序列分析并对其编码蛋白的二级结构、B细胞表位、T细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽进行预测。结果表明，OrfV-CQ株 F1L基因长1 023 bp，编码340 个氨基酸，与Shanxi株 F1L基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为98.4%和95.0%。OrfV-CQ 株 F1L基因编码蛋白的α-螺旋、β-片层、β-转角、无规则卷曲分别为11.21%、10.3%、2.73%、75.76%；可能存在5 个B细胞优势抗原表位，3 个CTL表位，4 个Th细胞表位，无跨膜结构域和信号肽。

羊口疮病毒； F1L基因；克隆；生物信息学分析

羊口疮(Orf)是由羊传染性脓疱病毒(Orf virus，OrfV)引起的一种接触性、传染性、嗜上皮性人畜共患传染病[1]，其主要特征病变为皮肤、口唇、鼻部和口腔黏膜等处形成增生性皮肤损伤，多发于6 月龄内的羔羊[2]。OrfV粒子长200～350 nm，宽140～220 nm，基因组长度为130～150 kb，不同毒株基因组长度有10～25 kb的差异[3]。 F1L基因位于OrfV的第59 个开放阅读框，编码的39 ku蛋白是表面微管的重要组成，该蛋白与病毒吸附、侵入宿主细胞及病毒成熟有关，还可以诱导机体产生中和抗体并介导细胞免疫[4-5]。本研究采用PCR技术扩增羊口疮病毒重庆分离株(OrfV-CQ) F1L基因，进行序列测定后，采用在线程序和生物信息学分析软件对其核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行生物信息学分析和预测，为重庆地区羊口疮的防治、OrfV的遗传变异研究奠定基础。……