猪流行性腹泻病毒陕西渭南株的遗传变异
2017-09-25吴萌萌许夏澎张彦明周宏超郭抗抗西北农林科技大学动物医学院陕西杨凌712100
吴萌萌,许夏澎,张彦明,周宏超,郭抗抗(西北农林科技大学 动物医学院,陕西杨凌 712100)
猪流行性腹泻病毒陕西渭南株的遗传变异
吴萌萌,许夏澎,张彦明,周宏超,郭抗抗
(西北农林科技大学 动物医学院,陕西杨凌 712100)
从陕西省渭南某规模化猪场采集疑似猪流行性腹泻(PED)仔猪病料进行病毒检测,旨在从基因遗传变异方面分析疾病发生的可能原因。通过RT-PCR从疑似仔猪20份小肠样品中检测到9份PED病毒阳性样品,并扩增出PED病毒M、 ORF3和S基因的部分序列。序列分析结果表明,与CV777疫苗株对比,样品渭南(WN)株PEDVM基因高度保守,同源性为98.2%; ORF3基因存在11处碱基突变,同源性为98.2%;S基因突变较大,存在4个插入区域,分别是164~166、177~179、181~186和416~418 nt,内分核心中和表位区(COE,499~638位氨基酸)存在9个氨基酸突变位点。遗传分析显示,WN株M基因与中国近期分离毒株亲缘关系较近; ORF3基因与同处在G1群中的中国毒株亲缘关系较近,而与CV777疫苗株亲缘关系较远;S基因与中国早期分离毒株及CV777疫苗株亲缘性较远,与当前的流行株亲缘关系密切。这些结果表明,WN株与CV777疫苗株相比,有明显的遗传变异倾向,可能导致目前PEDV疫苗免疫效果下降,PED疫情大规模流行。
猪流行性腹泻病毒;基因克隆;序列分析;遗传变异
猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea, PED)是由猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV)引起的猪的一种急性、高度接触性肠道传染病,临床表现为水样腹泻、体温升高、呕吐、脱水等[1-2]。本病多发于冬末春初和气候多变的寒冷季节,初生哺乳仔猪最为易感,传播快,治疗不及时的致死率可达100%,给养猪业造成极大的经济损失[3]。……
