吕有军杨卫军赵兰杰姚金波陈 伟李 燕张永山,*安阳工学院, 河南安阳 455000;中国农业科学院棉花研究所, 河南安阳 455000;棉花生物学国家重点实验室, 河南安阳 455000

陆地棉SRO基因家族的鉴定及表达分析

吕有军1,2,3杨卫军1赵兰杰2姚金波2陈 伟2李 燕2张永山2,*
1安阳工学院, 河南安阳 455000;2中国农业科学院棉花研究所, 河南安阳 455000;3棉花生物学国家重点实验室, 河南安阳 455000

SRO是植物特有的类RCD-ONE蛋白家族, 在植物抵御各种生物和非生物胁迫过程中具有重要的作用。本研究利用生物信息学方法从陆地棉遗传标准系TM-1 (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1)基因组中鉴定到12个SRO基因家族成员。多重序列比对及进化树分析表明, 12个陆地棉SRO均含有PARP和RST结构域, 聚为3类, 即A、B和C亚家族。转录组数据分析表明, TM-1全基因组中的Gh_D12G1442在茎中优势表达, Gh_D05G2064在萼片和雄蕊中优势表达; Gh_A05G3788在雄蕊中优势表达, Gh_A12G1318在雄蕊和纤维中优势表达; Gh_A12G2480、Gh_D12G2608、Gh_A05G2257和Gh_D05G2516在纤维中优势表达; Gh_A08G1390、Gh_D08G1685、Gh_A12G2663和Gh_D12G2054具有较为广泛的组织表达。逆境胁迫处理试验表明, Gh_A08G1390明显受冷处理和盐处理的诱导, Gh_D12G2054、Gh_D08G1685、Gh_A12G2663基因在不同的胁迫处理下受到不同程度的诱导。

陆地棉; 逆境胁迫; SRO; 基因组

植物适应外界高温、干旱等环境的变化是由自身特有的一些转录因子所调控, 一些转录因子在基因组水平上已经被分离, 例如NAC (NAM、ATAF和CUC), AP2 (APETALA2)/ERF (ethylene-responsive element binding factor), WRKY, Dof (DNA-binding with one finger)和ARF (auxin response factor)[1]。许多植物特有的转录因子家族成员参与植物特殊的发育过程, 参与并调控植物对外界环境的应激反应[2-4]。在这些植物特有的转录因子家族中, SRO (SIMILARTO-RCD-ONE)是最近被鉴定出的一类小蛋白家族,在植物逆境反应中具有重要的作用。……