红麻EST-SSR标记的开发及其多态性评价
2017-08-22万雪贝李东旭徐益徐建堂张力岚张列梅林荔辉祁建民张立武
万雪贝李东旭徐 益徐建堂张力岚张列梅林荔辉祁建民,*张立武,*
1福建农林大学作物科学学院 /作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室 /福建省作物设计育种重点实验室;2福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心,福建福州 350002
红麻EST-SSR标记的开发及其多态性评价
万雪贝1,2李东旭1,2徐 益1,2徐建堂1张力岚1,2张列梅1林荔辉1祁建民1,*张立武1,2,*
1福建农林大学作物科学学院 /作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室 /福建省作物设计育种重点实验室;2福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心,福建福州 350002
红麻是最重要的自然纤维作物之一,然而SSR标记的匮乏限制了其遗传改良。本研究从红麻90 175个EST序列中挑出含有转录因子的EST,开发了94对SSR引物。以24份不同红麻种质资源的DNA为模板,利用9%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测多态性。结果表明,85对引物(占90.4%)至少在2个材料之间存在多态性,表明开发的EST-SSR具有很好的多态性。其中,三核苷酸重复所占比例最多,重复基元AAT和ATG的多态性较高。聚类分析表明,24份红麻种质资源的遗传相似系数变化在0.62~0.92之间,表现出丰富的遗传基础。这些结果不仅丰富了红麻的分子标记数量,而且为红麻的遗传分析提供资源。
红麻;SSR;遗传多样性;标记开发
红麻(Hibiscus cannabinus)又叫大麻槿,属于锦葵科木槿属一年生草本韧皮纤维作物。具有耐旱、耐盐碱、抗逆性强、根系发达、生长速度快、生物产量高、易栽培等特点[1-3]。红麻主要是作为麻纺工业的原料,近年来在建材、可降解性塑料、吸污、饲料、造纸、地膜、麻油、药用等领域都有广泛的应用[4-6]。……
