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青海BYDV-GAV青稞分离物基因组克隆及结构特征分析

2017-08-16李廷芳吴淑华季英华赵文浩周益军郭青云

麦类作物学报 2017年7期
关键词:检测

李廷芳,吴淑华,季英华,赵文浩,周益军,郭青云

(1.青海大学农牧学院,青海西宁 810016; 2.江苏省农业科学院植物保护研究所/江苏省食品质量安全重点实验室-省部共建国家重点实验室培养基地,江苏南京 210014; 3.青海省农林科学院/农业部西宁作物有害生物科学观测实验站/青海省农业有害生物综合治理重点实验室,青海西宁 810016)



青海BYDV-GAV青稞分离物基因组克隆及结构特征分析

李廷芳1,2,3,吴淑华2,季英华2,赵文浩2,周益军2,郭青云1,3

(1.青海大学农牧学院,青海西宁 810016; 2.江苏省农业科学院植物保护研究所/江苏省食品质量安全重点实验室-省部共建国家重点实验室培养基地,江苏南京 210014; 3.青海省农林科学院/农业部西宁作物有害生物科学观测实验站/青海省农业有害生物综合治理重点实验室,青海西宁 810016)

大麦黄矮病毒(Barley yellow dwarf viruses,BYDVs)病是一种在世界范围内发生危害的禾谷类作物病毒病害。2014年笔者在对青海重要作物病毒病调查时发现田间青稞作物上有疑似BYDVs危害的症状,利用BYDVs引物对田间采集的9份典型症状病样进行了RT-PCR检测,结果均扩增到目的条带(约300 bp),随机抽选样品进行序列测定,BLAST分析结果显示其与BYDV-GAV同源性最为接近(99.2%)。为进一步明确该分离物的分类地位及基因组结构特征,根据已测定的BYDV-GAV序列设计全长扩增引物,利用分段法克隆了其全基因组序列,发现其全长为5 683 bp,具有典型的黄症病毒属的特征,编码6个ORF,有4个非编码区(UTR)。基因组序列聚类进化分析结果显示,其与BYDV-GAV聚类于同一分支,与中国陕西渭南小麦分离物亲缘关系较近。……

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