基于COI基因的西北太平洋金乌贼群体遗传学研究❋
2017-07-17郑小东池田実谷口順彦
郑小东, 许 然, 池田実, 谷口順彦
(1. 中国海洋大学水产学院,山东 青岛 266003; 2. 中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所,山东 青岛266003; 3. 东北大学农学部,日本 仙台981-8555)
基于COI基因的西北太平洋金乌贼群体遗传学研究❋
郑小东1,2, 许 然1,2, 池田実3, 谷口順彦3
(1. 中国海洋大学水产学院,山东 青岛 266003; 2. 中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所,山东 青岛266003; 3. 东北大学农学部,日本 仙台981-8555)
对中日海域5个金乌贼群体123个个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)基因片段进行测序,并应用于群体遗传多样性分析。经比对得到454 bp的核苷酸序列,并发现34个多态性位点,单突变位点15个,简约信息位点19个,38个单倍型。群体遗传多样性较高,总群体的平均单倍型多样性指数Hd为0.904,平均核苷酸多样性Pi为0.007 7,平均核苷酸差异数K为3.490。遗传分化系数(Fst)及遗传距离均显示中国日照群体与日本群体之间遗传差异远大于日本群体之间的遗传差异。日照群体与日本4个群体之间的遗传分化系数(Fst)和遗传距离分别为0.642 9~0.725 9和0.012 8~0.014 3之间;日本爱知、爱媛、长崎、福井等群体之间遗传分化较小。单倍型网络图及贝叶斯树均表明5个金乌贼群体分为2大支系,4个日本群体为一个支系,中国日照群体单独为一支系。Tajima’D检验和Fu’sFs检验及核苷酸错配分布说明,5个群体近期可能经历过种群扩张事件。
金乌贼;细胞色素氧化酶亚基I;群体遗传;遗传多样性
金乌贼(Sepiaesculenta)俗称墨鱼,主要分布于中国沿海、日本南部沿海、菲律宾群岛等海域[1-2],多群居于暖温带浅海性地区,水深在10~100 m左右。……