杨铁柱, 沈和定, 史艳梅, 刘 欣, 吴 欣, 李 杰



瘤背石磺表皮生长因子基因的克隆、结构及进化分析

杨铁柱, 沈和定, 史艳梅, 刘 欣, 吴 欣, 李 杰

(上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306)

首次在瘤背石磺()中克隆得到一种新的表皮生长因子(EGF)的cDNA序列全长。EGF基因cDNA的全长为1158bp, 命名为1, 其中开放阅读框长度为846 bp, 编码一条包含281个氨基酸残基的多肽链。根据氨基酸序列比对和结构域分析结果发现其含有2个保守的EGF结构域和1个EGF-like结构域, 每个结构域中均包含至少6个半胱氨酸残基, 且形成CX7 CX4-5 CX10-13 CXCX8 C结构, 其结构域由C1~C3、C2~C4和C5~C6之间形成的3个二硫键维持, 符合表皮生长因子家族及其相关蛋白的特征结构域, 但其余氨基酸序列与现有相关基因差异较大, 推测可能是一种新的EGF-like基因。利用MEGA6.0软件构建1与EGF家族相关蛋白的系统进化树, 表明EGF家族蛋白具有一定的物种特异性。

瘤背石磺(); EGF; 基因克隆; 系统进化分析

瘤背石磺()隶属于软体动物门(Mollusca)、腹足纲(Gastropoda)、肺螺亚纲(Pulmonata)、缩眼目(Systellommatophora)、石磺科(Onchidiidae), 是一种具有很高的食用和药用价值的贝类[1-3]。其分布区域常见于我国的江苏、上海、浙江、福建、广东等地的淡水和咸水交汇处的高潮带, 其温度适应性强, 分布范围广, 资源量非常丰富。目前国内外学者对石磺的研究主要集中在系统分类[4-5]、生物学特征、胚胎发育、营养价值、受精和繁殖机制以及活性物质的分离提取等方面[6-8], 未涉及功能基因组的范畴, 本文对于瘤背石磺功能基因的结构和进化进行了较为深入的分析, 希望能为瘤背石磺的功能基因研究积累资料。……