玉米大斑病菌StSNF1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
2017-07-01何世道杨瑞秀苑德鹏孙艳秋高增贵
何世道,杨瑞秀,刘 博,苑德鹏,姚 远,孙艳秋,高增贵
(沈阳农业大学 植物免疫所,辽宁 沈阳 110866)
玉米大斑病菌StSNF1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
何世道,杨瑞秀,刘 博,苑德鹏,姚 远,孙艳秋,高增贵
(沈阳农业大学 植物免疫所,辽宁 沈阳 110866)
为了明确StSNF1在玉米大斑病菌基因组中的位置,解析该基因编码蛋白的结构特征,探究该基因在侵染寄主的不同时期、分生孢子萌发侵染过程中以及不同碳源培养下的表达情况。结果表明,该基因ID号为008026214,全长3 046 bp,位于scaffold_17负链的97 793-100 838位置。StSNF1与玉米圆斑病菌SNF1同源关系较近,由877个氨基酸残基编码而成。StSNF1蛋白具有氮端的蛋白激酶结构域、氮端的碳代谢产物去阻遏蛋白激酶结构域和碳端的激酶相关结构域。在蛋白激酶结构域内,具有ATP结合位点和丝氨酸/苏氨酸活性位点。Real-time PCR结果表明,StSNF1在侵染后期高表达,72 h表达量最高;StSNF1在分生孢子萌发24 h时(即侵入丝形成时期)表达量最高;StSNF1在蔗糖为单一碳源的培养基中表达量最高,果胶培养基次之。综上所述,StSNF1与侵染寄主和碳源利用密切相关,在侵染后期发挥作用,利用寄主细胞内的非发酵型碳源进行次级侵染。
玉米大斑病菌;SNF1;蛋白激酶;表达分析
玉米大斑病是全世界玉米种植区的常见病害,它是由凸脐蠕孢菌(Exserohilumturcicum(Pass.) Leonard & Suggs)引起的一种玉米叶部病害[1-2]。在我国东北、华北北部、西北和南方山区冷凉玉米产区发病比较严重[3]。玉米大斑病流行可使玉米减产30%,而种植感病品种产量损失可达50%之多[4],给玉米生产带来严重威胁。……
