飞蝗内表皮蛋白基因LmAbd-5的表达与功能分析
2017-06-15赵小明贾盼勾昕刘卫敏马恩波张建珍
赵小明,贾盼,2,勾昕,2,刘卫敏,马恩波,张建珍
(1山西大学应用生物学研究所,太原 030006;2山西大学生命科学学院,太原 030006)
飞蝗内表皮蛋白基因LmAbd-5的表达与功能分析
赵小明1,贾盼1,2,勾昕1,2,刘卫敏1,马恩波1,张建珍1
(1山西大学应用生物学研究所,太原 030006;2山西大学生命科学学院,太原 030006)
【目的】基于飞蝗(Locusta migratoria)转录组数据库获得内表皮蛋白(endocuticle structural glycoprotein)基因LmAbd-5的cDNA序列,分析该基因的序列特征和mRNA表达特性,采用RNAi方法分析其生物学功能,探讨其在飞蝗表皮形成中的作用,为害虫防治提供新的分子靶标。【方法】采用生物信息学方法搜索飞蝗转录组数据库,获得LmAbd-5 cDNA全长序列并克隆验证;采用SignalP在线软件分析蛋白的信号肽,利用SMART网站预测其功能域,使用MEGA 7.0软件中neighbor-joining(NJ)方法,与其他昆虫同源序列进行聚类分析;采用reverse-transcription quantitative PCR(RT-qPCR)方法检测LmAbd-5在飞蝗5龄第2天若虫不同组织部位和5龄不同发育时期体壁组织中的表达情况,揭示其组织和时期表达模式;采用RNA干扰(RNAi)技术及透射电镜技术(TEM)观察沉默LmAbd-5后对飞蝗生长发育和表皮结构的影响。【结果】通过搜索得到LmAbd-5 cDNA全长序列并进行了克隆和测序验证,获得520 bp全长cDNA序列,其中ORF为303 bp;基因结构分析显示该基因含有3个外显子;功能域分析发现其含有1个信号肽和1个几丁质结合域(chitin binding domain 4,ChtBD4),与沙漠蝗、白蚁、赤拟谷盗等的Abd-5结构类似;BLAST分析结果表明Abd-5在昆虫中高度保守,飞蝗与沙漠蝗Abd-5序列一致度高达81%;对其保守基序进行WebLogo分析发现LmAbd-5属于表皮蛋白CPR家族中的RR-1亚类;聚类分析结果显示,LmAbd-5与沙漠蝗和白蚁的Abd-5显示出较近的亲缘关系;……
