王琳，李新凤，徐玉梅，畅引东，王建明

（山西农业大学农学院，山西太谷030801）

山西省植物病原镰孢菌种群分布及遗传变异分析

王琳，李新凤，徐玉梅，畅引东，王建明

（山西农业大学农学院，山西太谷030801）

【目的】通过对镰孢菌（Fusarium）ITS、EF-1α和β-tubulin 3个基因序列比较分析，筛选适合于镰孢菌种类鉴定的基因序列，并以此序列分析山西省植物病原镰孢菌种群分布及遗传变异情况。【方法】从2013—2015年在山西省11市28县（区）采集分离的625株镰孢菌菌株中选取形态学清晰的菌株进行ITS、EF-1α和β-tubulin基因序列联合分析，运用 Sequencher软件对序列进行拼接和校对，将测序结果与 NCBI及FUSARIUM-ID数据库中所有已公布的序列进行 BLAST分析，结合下载概念清晰或标准种序列，运用 ClustalX 和GelDoc软件进行序列对齐和编辑，运用MEGA、Excel、DNAstar和TaxonGap软件分析镰孢菌种内种间遗传变异情况，从ITS、EF-1α和β-tubulin中筛选适合镰孢菌种类鉴定的基因序列，并以此序列分析山西省镰孢菌的种群分布特点等。【结果】在3个候选基因序列中，EF-1α基因序列是最适用于镰孢菌种类鉴定的基因序列，其种间平均遗传距离分别是种内平均遗传距离的24倍，种内差异小于种间差异的种的数量最多，达到供试种的73%，物种鉴定准确率最强，达到87%。基于EF-1α基因片段的系统发育分析结果表明，在供试的 27种镰孢菌中，有 22种表现出单系性，相同种的不同菌株以较高支持率聚成独立支。在 27种镰孢菌中，F. oxysporum是山西省镰孢菌的优势种，分离频率最高（22.1%），且分布最广，在23个县（区）均有分布；其次是F. solani（13.8%），在14个县（区）有分布。从不同地区镰……