宏基因组方法比较分析深海和珠江口沉积物中抗生素耐药基因的特征*
2017-06-10林岚林琳陈恩中陈保卫王晓玮陈清
林岚 ,林琳,陈恩中,陈保卫,王晓玮,陈清
(1. 南方医科大学公共卫生学院,广东 广州 510515; 2. 南方医科大学珠江医院,广东 广州 510282; 3. 中山大学孙逸仙纪念医院,广东 广州 510020; 4. 中山大学海洋学院,广东 广州 510275)
宏基因组方法比较分析深海和珠江口沉积物中抗生素耐药基因的特征*
林岚1, 2,林琳3,陈恩中2,陈保卫4,王晓玮4,陈清1
(1. 南方医科大学公共卫生学院,广东 广州 510515; 2. 南方医科大学珠江医院,广东 广州 510282; 3. 中山大学孙逸仙纪念医院,广东 广州 510020; 4. 中山大学海洋学院,广东 广州 510275)
细菌对抗生素的耐药性是全球关注的环境健康问题之一。该研究旨在使用宏基因组方法比较分析西太平洋深海和珠江口沉积物中抗生素耐药基因,认识抗生素使用与环境细菌耐药性间的关系。研究发现,深海沉积物多重耐药基因的含量高达77.8%;珠江口沉积物多重耐药基因只有27.2%,常用抗生素的耐药基因(磺胺类、大环内酯类、氨基糖苷类等)含量明显提高(约70%)。沉积物中共发现45种耐药基因亚型,其中7种基因亚型(acrB、amrB、bacA、ceoB、macB、mexB和smeE)能在所有沉积物中发现。深海沉积物中质粒仅携带0.3%的耐药基因,而珠江口沉积物则超过40%。研究表面,由于珠江口周边区域常用抗生素的广泛使用,其沉积物中细菌抗生素耐药性明显提高、耐药机制趋于多样化。
抗生素耐药基因;宏基因组分析;沉积物;西太平洋;珠江口
抗生素耐药基因(antibiotic resistance genes, ARGs)作为一种新兴的环境“污染物”已受到广泛的重视[1]。从人类活动干扰环境采集的水、土壤和沉积物等样品中,经常发现高丰度的多样的抗生素耐药基因[2-4]。……
