国家蛋白质科学研究（上海）设施（简称“上海设施”，NFPS）位于上海市浦东新区张江高科技园区，总投资7.56亿元，占地面积3.3万平方米。

上海设施由规模化蛋白质制备系统、蛋白质晶体结构分析系统、蛋白质核磁共振分析系统、集成化电镜分析系统、蛋白质动态分析系统、质谱分析系统、复合激光显微镜系统、分子影像系统和数据库与计算分析系统组成，集成了用于不同空间和时间分辨率蛋白质结构分析的各种大型仪器和设备，形成了功能完备的蛋白质研究先进装备体系，是全球生命科学领域首家综合性大科学装置，是探索生命奥秘的国之利器。

上海设施于2010年12月开工建设，2014年3月竣工，2015年7月28日通过国家验收，正式向国内外用户开放。截至2017年2月，上海设施已累计运行超过23万小时，执行用户课题2 000多个。设施开放以来，已吸引了包括中国科学院研究院所、高等院校、国内和国际医药企业等近200家科研单位的研究人员前来开展前沿科学研究。设施用户、设施科研团队、设施技术团队均取得一系列重要科研成果，发表SCI论文150余篇。

基于上海设施，专门成立了国家蛋白质科学中心•上海（简称中心，NCPSS）。中心隶属中国科学院生物化学与细胞生物学研究所，具体负责上海设施的运行管理，同时围绕蛋白质科学的重大科学问题开展前沿研究和技术创新。主要研究内容涵盖遗传信息的解码与维护、跨膜生物学研究、非编码RNA以及超大分子复合物前沿研究方法和技术研发等学科前沿研究方向。……