中华鳖tyrp-1基因的生物信息学分析
2017-06-05王亚光邵巧巧孙冰冰张耀红管越强
王亚光,邵巧巧,孙冰冰,张耀红,管越强
(1.河北大学 生命科学学院,河北 保定 071002;2.保定水产技术推广站,河北 保定 071051)
中华鳖tyrp-1基因的生物信息学分析
王亚光1,邵巧巧1,孙冰冰1,张耀红2,管越强1
(1.河北大学 生命科学学院,河北 保定 071002;2.保定水产技术推广站,河北 保定 071051)
为阐明中华鳖酪氨酸酶相关蛋白1(TYRP-1)基因tyrp-1 及蛋白质结构与性质,利用相关软件、数据库和方法对其进行了生物信息学分析.结果显示,基因转录本全长为2 829 bp,编码535个aa. 预测TYRP-1蛋白分子质量为60.16 ku,理论等电点为5.35,为不稳定蛋白;N端含有信号肽,与信号识别蛋白结合后,促进其穿越内质网膜进入内质网腔;C端含有跨膜结构域,锚定于细胞膜上,发挥重要的生物学功能;TYRP-1蛋白含有2个铜离子结合结构域,与DCT蛋白有明显的相互作用.
中华鳖;tyrp-1基因;生物信息学
酪氨酸酶相关蛋白1(TYRP-1)基因tyrp-1是第1个被成功克隆的色素基因,是酪氨酸酶基因家族中的重要组成部分.酪氨酸酶相关蛋白1(EC:1.14.18.-)是黑色素合成途径中重要的酶,具有二羟基吲哚酸氧化酶的活性,可以催化5,6-二羟基吲哚羧酸(5,6-dihydroxyindole-2-carboxylic acid, DHICA)氧化生成5,6-吲哚醌羧酸(indole-5,6-quinone-2-carboxylic acid)[1]. Zhao等[2]利用含有tyrp-1基因的逆转录载体转染人体TYRP-1蛋白缺陷的黑色素细胞,证明了外源的tyrp-1基因可以提高酪氨酸酶的活性. 因此,在维持酪氨酸酶的稳定性和调节催化活性中发挥了重要作用[3]. TYRP-1还在黑色素合成的下游途径中影响黑色素小体的成熟、黑色素瘤细胞的增殖和凋亡[4]. TYRP-1蛋白活性高低可影响真黑色素与伪黑色素合成转换,活性……