番鸭细小病毒安徽分离株结构蛋白基因的克隆及序列分析
2017-04-13张丹俊赵瑞宏沈学怀胡晓苗侯宏艳潘孝成周学利
戴 银,张丹俊,赵瑞宏,沈学怀,胡晓苗,侯宏艳,潘孝成,周学利
(安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽合肥 230031)
番鸭细小病毒安徽分离株结构蛋白基因的克隆及序列分析
戴 银*,张丹俊*,赵瑞宏,沈学怀,胡晓苗,侯宏艳,潘孝成,周学利
(安徽省农业科学院畜牧兽医研究所,安徽合肥 230031)
为研究番鸭细小病毒(MDPV)安徽分离株的遗传变异特征,通过PCR扩增获得了MDPV结构蛋白(VP)基因全长序列AH-MDPV-VP,并将该序列与GenBank中登录的12条MDPV和鹅细小病毒(GPV)VP基因序列进行比对。结果显示,AH-MDPV-VP基因全长2 199 bp,包括完整的VP1、VP2和VP3蛋白编码区。MDPV与GPV的VP基因部分序列一致,但具有明显的差异。进化分析显示,MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH为同一分支,亲缘关系较近。同源性分析显示二者核苷酸序列同源性最高,为99.9%,且AH-MDPV-VP与GPV毒株SHFX1201的序列同源性也有89.5%。此外安徽分离株与其他MDPV的VP1、VP2和VP3基因同源性有逐步下降的趋势,而与GPV则相反呈上升趋势。进一步显示MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH相似,可能为MDPV和GPV基因重组型水禽细小病毒。
番鸭细小病毒;结构蛋白基因;克隆;序列分析
番鸭细小病毒(Muscovy duck parvovirus,MDPV) 属于细小病毒科细小病毒亚科依赖病毒属成员[1]。MDPV可引起番鸭的细小病毒病,该病是一种严重危害番鸭养殖业的急性传染性病,可通过多种方式传播,无明显的季节性,但冬春两季多发,1周龄~3周龄雏番鸭较为易感,一旦感染,发病率和病死率均很高。耐过病愈鸭大多生长发育缓慢,其经济价值受到很大影响[2-5]。MDPV基因组均为线性、单链DNA,大小约为5 kb,包括两个开放阅读框(open reading frame,ORF),左侧编码非结构蛋白(NS),右侧编码结构蛋白(VP)。……
