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马铃薯疮痂病高效拮抗菌的筛选及鉴定

2017-04-05高同国姜军坡郭晓军张冬冬

江苏农业科学 2016年12期
关键词:生物防治

高同国++姜军坡++郭晓军++张冬冬++朱宝成

摘要:为获得对马铃薯疮痂病(potato scab)病原菌具有较强拮抗作用的优良菌株,以笔者所在实验室保存的237株细菌为出发菌株,采用十字交叉划线法和平板扩散法进行初筛和复筛。经筛选后得到1株拮抗活性明显的菌株 12-82,其抑菌圈直径达26.2 mm。经菌落菌体形态观察、16S rRNA基因序列分析及生理生化试验,将菌株12-82初步鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens),该研究为开发防治马铃薯疮痂病的生物菌剂奠定了基础。

关键词:马铃薯疮痂病;生物防治;解淀粉芽孢杆菌;菌种鉴定;生物菌剂

中图分类号: S435.32文献标志码: A

文章编号:1002-1302(2016)12-0157-03

收稿日期:2015-11-17

基金项目:河北省自然科学基金(编号:C2015204031)。

作者简介:高同国(1984—),男,河北邢台人,博士,讲师,主要从事植物真菌病害及生物防治研究。E-mail:gtgrxf@163.com。

通信作者:朱宝成,博士,教授,博士生导师,主要从事微生物发酵秸秆饲料研究。E-mail:baochengzhu@126.com。

马铃薯种植区域广泛,仅次于水稻、小麦和玉米。近年来,马铃薯疮痂病(potato scab)的发生逐渐加重,已成为马铃薯主要病害之一。该病主要由链霉菌引起,可危害马铃薯块茎,感病的薯块表面形成痂状病斑,影响马铃薯的外观品质,从而降低薯块的商品价值[1-2],严重时还会延迟马铃薯出苗,甚至减少产量[3]。在我国,引起疮痂病的病原菌有疮痂链霉菌(Streptomyces scabies)、酸性疮痂链霉菌(S. acidiscabies)、肿痂链霉菌(S. turgidiscabies)和加利利链霉菌(S. galilaeus)等多种病原菌[4-5]。

目前缺乏有效手段防治马铃薯疮痂病,而利用生物防治方法越来越多地引起人们的重视。Beauséjour等利用生物制剂与壳聚糖结合用于防治疮痂病取得良好效果[6]。Neeno-Eckwall等在田间试验中使用S.diastatochromogenes PonSSII防治疮痂病,症状明显减轻[7]。Hiltunen等报道利用非致病性链霉菌也可以防治疮痂链霉菌[8-10]。刘大群等采用生防拮抗链霉菌防治马铃薯疮痂病,结果表明,不同的菌系有明显的防效差异,单个拮抗菌的防效优于2个拮抗菌的混合使用效果[11]。另外,利用微生物代谢产物防治疮痂病也是有效手段之一,Han等报道利用芽孢杆菌产生的代谢物macrolactin A有效地防治马铃薯疮痂病,使疮痂病的发病率降低了40%[12]。

本研究以疮痂病病原菌疮痂链霉菌作为指示菌,从笔者所在实验室保存的237株细菌中筛选对疮痂病有拮抗作用的菌种,并通过菌落菌体形态特征、16S rRNA基因序列和生理生化特性对拮抗活性较强的菌株进行鉴定,该研究以期为马铃薯疮痂病的生物防治提供理论基础。

[BT1#]1材料与方法

1.1试验菌株

马铃薯疮痂病病原菌:疮痂链霉菌,来源于河北农业大学植物保护学院植物病理实验室。237株细菌来源于河北农业大学生命科学院制药工程系。

1.2供试培养基

牛肉膏蛋白胨培养基(NA):牛肉膏3.0 g、蛋白胨 10.0 g、NaCl 5.0 g、琼脂15.0~20.0 g,加H2O至1 L,pH值7.0~7.2;NA培养基中不添加琼脂为NB培养基;燕麦琼脂培养基(OMA):琼脂18.0 g,加2%燕麦汁至1 L,调pH值至7.2。以上培养基在121 ℃高压灭菌30 min。

1.3方法

1.3.1制备病原菌孢子悬浮液

将病原菌接种于OMA固体培养基中,置于28 ℃培养箱中培养3~5 d。取10 mL无菌水于长满疮痂病病原菌的培养皿中,用玻璃棒轻刮培养物表面的孢子,再用装有脱脂棉的5 mL无菌注射器筒过滤除去菌丝团,滤液倒入离心管中,4 ℃、6 000 r/min离心15 min,使孢子沉淀,离心完毕后倒掉上清,将离心管在漩涡混合器上振荡,使孢子沉淀物分散于残存的无菌水中。在无菌条件下,将制备好的菌种用无菌水稀释,孢子悬浮液的浓度不低于 107 CFU/mL。

1.3.2拮抗菌筛选

初筛:取100 μL孢子悬浮液均匀涂抹在OMA平板上,将已活化的待筛选菌种以十字划线方式接种于培养皿中。28 ℃培养7 d,观察抑菌圈的大小。

复筛:将NA培养基上活化好的待筛选细菌接种于NB培养基,37 ℃、200 r/min发酵48 h,10 000 r/min离心10 min,收集上清液,并经细菌滤器(0.22 μm)过滤,即得无菌发酵液,待用。取100 μL孢子悬浮液均匀涂抹在OMA平板上,将培养皿平均分为4个扇形区域,在扇形中央用打孔器打1个直径6.0 mm的孔,用移液器取50 μL无菌发酵液滴于孔内,28 ℃培养7 d,测量抑菌圈的直径(mm)。每处理重复3次。

1.3.316S rRNA基因PCR扩增

用十六烷基三甲基溴化銨(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,简称CTAB)提取菌株的总DNA[13],选用16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增。正向引物为27F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,反向引物为1492R:5′-CTACGGCTACCTTGTTACGA-3′。25 μL PCR反应体系:DNA模板2 μL,10×缓冲液2.5 μL,正向引物与反向引物各0.5 μL,10 mmol/L dNTP 0.25 μL,Taq DNA聚合酶(5 U/μL)0.25 μL,ddH2O补足至25 μL。PCR反应条件:94 ℃ 5 min;94 ℃ 1 min,50 ℃ 1 min,72 ℃ 1 min,30个循环;72 ℃ 10 min。PCR结束后,采用1%琼脂糖凝胶对PCR结果进行检测,并交华大基因进行序列测定。将菌株的16S rRNA基因序列与GenBank中已知的核酸序列进行BLAST比对,获得相近属种菌株序列,利用ClustalX 1.83、MEGA 5软件构建 Neighbour-Joining系统发育树。

1.3.4形态学与生理生化鉴定

将优良拮抗细菌菌株接种于NA培养基上,30 ℃培养24 h,观察菌落形态并经革兰氏染色后镜检。参照《伯杰细菌鉴定手册》[14]和《常见细菌系统鉴定手册》[15],采用细菌微量生化反应管对硝酸盐还原、大分子利用、酶类利用以及耐盐性等生理生化指标进行测定。

2结果与分析

2.1对马铃薯疮痂病菌的抑菌效果

从237株细菌中筛选得到4株对病原菌抑制效果较好的菌株,分别为3011、Z-6、12-82、12-34(图1),其中菌株 12-82抑菌活性最强,抑菌圈直径达26.2 mm。

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2.2菌落、菌体形态

拮抗菌株12-82在NA培养基平皿上生长良好,菌落形态呈圆形或近圆形,略隆起,乳白色,不透明,表面光滑,无色素产生,延长培养时间发现,菌落干燥,有褶皱及突起,边缘不整齐(图2-A)。在光学显微镜下观察发现,经革兰氏染色后的拮抗细菌12-82菌株的菌体呈杆状(图2-B)。

2.3总DNA提取和16S rRNA基因扩增结果

进一步采用16S rRNA基因对拮抗细菌12-82进行分子水平鉴定。首先采用CTAB法提取细菌的总DNA(图3),表明该DNA可用于PCR扩增。

用16S rRNA基因通用引物27F、1492R对菌株12-82总DNA进行PCR扩增,扩增结果具有单一特异性条带(图4),可直接将PCR产物送华大基因进行测序。

以菌株12-82的总DNA为模板,PCR 扩增得到该菌株1.5 kb左右的基因片段,测序后提交GenBank获取登录号(KT247502),经BLAST比对获取若干同源序列。用 MEGA 5 构建系统发育树(图5),可见菌株12-82与Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum FZB42的亲缘关系最近(9778%)。

2.4生理生化试验结果

根据菌落菌体形态及16S rRNA基因鉴定结果,对菌株12-82的生理生化性质进行测定。从表1可见,菌株12-82经动力试验、伏-普反应(Voges-Proskauer reaction,简称 V-P反应)、接触酶、糖类发酵、硝酸盐还原、酪素水解、柠檬酸盐利用、明胶水解、淀粉水解等反应均为阳性,甲基红、丙二酸盐反应均为阴性,与已报道的解淀粉芽孢杆菌性质一致。

综合菌株12-82的形态特征、16S rRNA基因序列及菌株[CM(25]的生理生化特性,对照《伯杰细菌鉴定手册》《常见细菌系统鉴定手册》,鉴定拮抗菌12-82菌株属于解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。

3讨论

马铃薯疮痂病是难以防治的世界性土传病害,目前缺乏防治该病害的有效手段,而生物防治已成为防治植物病害的有效手段,芽孢杆菌因营养简单、繁殖速度快、可产生内生芽孢、抗逆能力强、易定殖等优点而逐渐成为世界生物防治的重点。郭凤柳等对从土壤中分离的对疮痂病病原菌具有拮抗活性的菌株B1进行了鉴定,菌株B1属于枯草芽孢杆菌[16]。李勇筛选出1株对疮痂病有抑制作用的枯草芽孢杆菌ZWQ-1,其抑菌带宽度最高为18.75 mm[17]。除上述报道外,国内关于疮痂病生物防治的报道较少。

本研究从笔者所在实验室保存的237株细菌中筛选获得1株对疮痂病病原菌疮痂链霉菌具有较强拮抗作用的菌株 12-82,其抑菌圈直径达26.2 mm。经形态观察、16S rRNA基因序列分析及生理生化试验,初步鉴定该菌株为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。本研究增加了国内研究马铃薯疮痂病生防菌株资源,为菌株12-82抑菌机制研究及应用奠定了基础。

[HS2][HT8.5H]参考文献:[HT8.SS]

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