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关于中国微生物组数据中心建设的思考*

2017-03-27马俊才赵方庆苏晓泉吴林寰

中国科学院院刊 2017年3期
关键词:分析研究

马俊才 赵方庆 苏晓泉 徐 健 吴林寰

1 中国科学院微生物研究所 北京 100101

2 中国科学院北京生命科学研究院 北京 100101

3 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 青岛 266101

关于中国微生物组数据中心建设的思考*

马俊才1赵方庆2苏晓泉3徐 健3吴林寰1

1 中国科学院微生物研究所 北京 100101

2 中国科学院北京生命科学研究院 北京 100101

3 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 青岛 266101

近年来,美国、欧盟都陆续启动了微生物组相关的研究项目。但微生物组大数据的收集、存储、功能挖掘和开发利用一直是制约微生物组发展的核心问题。文章分析了我国目前在微生物组数据管理中存在着标准不统一、缺乏跨领域的数据整合、高质量的参考数据库和数据的深度挖掘技术等问题,提出适时启动“中国微生物组”计划,建立中国微生物组数据中心,在微生物组数据标准化的基础上,建立微生物组大数据计算、存储和共享平台,开发微生物组大数据挖掘的新方法,实现我国微生物组数据资源的系统管理和高效利用。

微生物组,标准化,大数据,中国微生物组数据中心

DOI10.16418/j.issn.1000-3045.2017.03.010

微生物组(Microbiome)是指一个特定环境中的总的微生物群落,通过在一定环境空间的相互作用和平衡,形成了相对稳定的生态环境并具有一定的生理功能。长期以来,微生物群落被认为在营养代谢、污染物降解、维持动植物和人体生态系统平衡中发挥着关键作用,然而,对其中的作用机制并不清楚。高通量测序……

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