334份青藏高原野生大麦群体结构及连锁不平衡水平分析
2017-03-23宋远方夏腾飞徐金青王寒冬沈裕虎
宋远方,夏腾飞,徐金青,王寒冬,沈裕虎,3,王 蕾,3
(1.中国科学院 高原生物适应与进化重点实验室,西北高原生物研究所,西宁 810001;2.中国科学院大学,北京 100039;3.青海省作物育种重点实验室,西宁 810001)
334份青藏高原野生大麦群体结构及连锁不平衡水平分析
宋远方1,2,夏腾飞1,2,徐金青1,2,王寒冬1,沈裕虎1,3,王 蕾1,3
(1.中国科学院 高原生物适应与进化重点实验室,西北高原生物研究所,西宁 810001;2.中国科学院大学,北京 100039;3.青海省作物育种重点实验室,西宁 810001)
利用1 389个DArT标记对334份青藏高原西藏野生大麦材料进行遗传多样性、群体结构和连锁不平衡水平分析。结果显示,参试群体DArT标记的多态性信息含量(PIC)值为0.005 6~0.500 0,平均值为0.248 9。运用贝叶斯、主坐标分析2种方法对野生大麦的群体结构进行研究。结果显示参试材料存在明显的群体分层,各个亚群中的个体不同来源、不同棱形、不同皮裸性混杂分布。以标记位点间的相关系数平方(r2)作为衡量连锁不平衡(LD)水平的参数,在整体上,LD水平随着遗传距离的增加递减,各个染色体内也有相同的趋势,不同染色体的LD水平不同。以r2=0.2为阈值统计,大于0.2的位点组合中,P<0.001的位点组合比例为3.31%,r2的平均值为0.454;群体的LD衰减距离为0.3 cM,衰减较快。青藏高原地区野生大麦群体结构和连锁不平衡水平的研究为杂交育种和关联图谱的构建奠定了良好的基础。
大麦;DArT标记;群体结构;连锁不平衡
大麦栽培历史悠久,是世界上第四大粮食作物[1]。大麦是农艺学上重要的大基因组作物,具有大量的品种,在世界范围内广泛分布[2]。中国大麦遗传资源丰富,但其遗传多样性在地区间有很大的差异[3]。野生二棱皮大麦(Hordeumspontaneum)是现在栽培大麦的祖先,在新石器时期就被驯化作为一种粮食作物[4]。……
