APP下载

环介导等温扩增技术对锦鲤疱疹病毒的快速检测

2017-03-04刘露

海峡科技与产业 2017年1期
关键词:疱疹病毒锦鲤特异性

刘露

摘 要:为建立一种快速检测锦鲤疱疹病毒(CyHV-3)的环介导等温扩增方法(LAMP),本研究根据GenBank中登录的CyHV-3 TK基因编码区序列设计了LAMP特异性引物,通过优化反应条件,建立了检测CyHV-3的LAMP方法。表明本实验建立的该检测方法具有高灵敏度、高特异性、快速和简便的特性,适用于临床上对锦鲤疱疹病毒3的快速诊断。

关键词:LAMP;CyHV-3;快速检测

0 引言

锦鲤疱疹病毒病是由鲤疱疹病毒3型Cyprinid herpesvirus 3(CyHV-3)感染引起鲤鱼、锦鲤以及普通变种鳃坏死和间质性肾炎的一种高致病性、高传染性、高死亡率疾病。现已在全世界范围内流行,严重威胁着鲤鱼和锦鲤养殖业的发展。

目前,已经建立的对CyHV-3的检测方法有DNA杂交、PCR、套式PCR、荧光定量PCR和环介导等温扩增方法(loop-mediatedisothermal amplification,LAMP)等。以上检测方法在临床检测中均存在局限,如仪器设备,技术人员和成本等。LAMP检测方法对仪器要求低,根据颜色变化通过肉眼可以对结果进行判断,适用于现地检测。

1 材料与方法

1.1 主要实验材料

含有CyHV-3 TK基因的重组质粒,Bst DNA聚合酶(长片段)、Thermopol II反应缓冲液,SYBR Green I荧光染料,Betaine,dNTP,DNAMarker,病毒DNA提取试剂盒,

1.2 引物设计

根据中华人民共和国水产行业标准中,鲤疱疹病毒检测方法要求的CyHV-3的TK基因的序列,使用Primer Explorer V4设计8条特异性引物(表1),并交由上海生工合成。

1.3 LAMP扩增

LAMP反应体系:1μl F3/F3(10μM),1μl B3/B3(10μM),1μl FIP/FIP(50μM),1μl BIP/BIP(50μM),4μl dNTPs(25mM),4μl 10xThermopol buffer,8U BstDNA聚合酶,3μl Betaine(0.8M),2.5μl MgCl2(25mM),2μl模板DNA和4.5μl ddH2O,石蜡密封液面,之后加入2μlSYBR Green I,65℃孵育60min,80℃10min灭活酶终止反应。

反应管淡绿色为阳性,淡橘黄色为阴性。结果判定采用琼脂糖凝胶电泳检测。

1.4 LAMP反应条件优化

分别通过不同温度以及不同时间进行LAMP扩增,优化dNTPs、Betaine、MgCl2等其他反应条件。

2 结果

LAMP的建立和检测:以特异性引物对CyHV-3进行LAMP扩增,肉眼观察,CyHV-3阳性管浑浊.而阴性管未见浑浊,加入荧光染料SYBR Green I后,CyHV-3阳性管反应液变为淡绿色,而阴性对照管为棕色。

琼脂糖凝胶电泳检测结果显示,CyHV-3阳性管出现典型的梯形条带,而阴性管没有产生条带。

经优化后,LAMP体系最佳反应时间为40min,最佳反应温度为65℃,dNTPs最适浓度为1.2mM、Betaine最佳浓度为0.8mM、MgCl2最佳浓度为8mM。

3 讨论

自从锦鲤疱疹病毒发现以来,各个地区几乎每年都有流行。目前,锦鲤疱疹病毒病的全球性暴发,给锦鲤观赏业、鲤鱼养殖业以及国际贸易造成了严重的经济损失。

PCR是目前较为精确检测CyHV-3感染的方法。Bercovier等基于CyHV-3的胸苷激酶基因建立的PCR方法,能够区分CyHV-3与CyHV-1和CCV。刘荭等建立了nestedPCR,已作为我国检测CyHV-3的标准方法。范万红等建立的实时荧光定量PCR缩短了检测时间,适用于进出口检验检疫。LAMP法是一种新式恒温核酸扩增方法,该扩增法具有简便、快速、准确、廉价、易检测等特点。Gunimaladevi等基于TK基因设计引物,建立了快速检测CyHV-3的LAMP法。Soliman等在产物中加入SYBR GreenⅠ,根据其颜色的变化来判定结果,从而更加直观。LAMP检测法不需要特殊的仪器设备,适合现场诊断。因此LAMP法具有良好的应用前景。

本实验建立的LAMP方法具有以下特点:第一速率快,仅40min左右即達到反应的平台期;第二、对反应装置要求较低,恒温水浴锅、PCR仪均能作为LAMP的恒温反应装置;第三、结果观察简单,添加SYBR Green I核酸染料后肉眼即可观察。本文提供了稳定的CyHV-3检测体系,为控制CyHV-3的流行与及时检测提供了技术支持。

致谢

本研究由河北省研究生创新项目提供资金支持

参考文献

[1] 刘荭,史秀杰,高隆英,等.进口锦鲤暴发病病原的nested-PCR鉴定[J].华中农业大学学报,2002,21(5):

414-418.

[2] 范万红,刘荭,岳志芹,等.锦鲤疱疹病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用[J].中国海洋大学学报(自然科

版),2007,37(5):785-788.

[3] 孟庆峰,刘阳,刘金华,等.锦鲤疱疹病毒双基凶检测方法的研究[J].巾国预防兽医学报,2012,34(1):53-55

[4] 孟庆峰,张琼.利用PCR方法检测锦鲤疱疹病毒3个主要靶基因[J].中国预防兽医学报,2011,33(4):316-18.

[5] 朱霞,李新伟,王好,等.一株锦鲤疱疹病毒的分离与鉴定[J].中国预防兽医学报,201l,33(5):340-343.

猜你喜欢

疱疹病毒锦鲤特异性
每到冬天,东北就变成了“冻”北
90后、00后行为观察大赏
有趣的锦鲤
小编,来条“锦鲤”
荔枝草提取物体外抗单纯疱疹病毒Ⅰ型的研究
精确制导 特异性溶栓
溶瘤单纯疱疹病毒治疗肿瘤的研究进展
BOPIM-dma作为BSA Site Ⅰ特异性探针的研究及其应用
重复周围磁刺激治疗慢性非特异性下腰痛的临床效果
儿童非特异性ST-T改变