李宁，杨生保，杨涛，王柏柯，唐亚萍，王强，帕提古丽·艾斯木托拉，余庆辉

(新疆农业科学院园艺作物研究所，乌鲁木齐 830091)

辣椒Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列的克隆及分析

李宁，杨生保，杨涛，王柏柯，唐亚萍，王强，帕提古丽·艾斯木托拉，余庆辉

(新疆农业科学院园艺作物研究所，乌鲁木齐 830091)

【目的】从辣椒基因组中克隆Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列，分析其家族特性及进化关系。【方法】根据Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶保守区域设计简并引物，通过PCR扩增、回收、克隆、测序得到的目的基因序列。【结果】克隆从辣椒基因组14条逆转录转座子逆转录酶序列，序列大小均为340 bp左右。生物信息学分析表明，序列长度变化范围为310～345 bp，同源性范围为60.2%～99.1%。这些核苷酸序列具有较高的异质性，主要表现为终止密码子突变。聚类分析可将所得序列分为5大类，基于逆转录酶序列进行的不同物种进化树分析显示，第Ⅳ、Ⅴ类序列与荸荠、潘那利番茄等组成一大类，可能是逆转录转座子横向传递的结果。【结论】辣椒Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列具有普遍性、异质性等特点，与荸荠、潘那利番茄等物种的同类型逆转座子可能有相同的起源。

辣椒；Ty3-gypsy逆转录转座子；逆转录酶

0 引 言

【研究意义】逆转录转座子是刺激寄主细胞基因组发生多种形式的遗传重排，促进基因组的流动，引发植物性状突变，有利于生物遗传多样性及基因组遗传进化的关键因子，作为一种可移动的遗传因子分散在真核基因组中[1]。这种特殊的转座方式使其在基因组中具有高拷贝性，通过克隆与分析其序列，对解析植物基因组突变、进化及遗传多样性具有重要意义[2-3]。……