吕志堂， 王 静， 周燕霞， 张维维

(1.河北大学 生命科学学院 河北省微生物多样性研究与应用实验室，河北 保定 071002；2.药物化学与分子诊断教育部重点实验室(河北大学)，河北 保定 071002)



·大家专版·

α-变形菌纲新的保守特征性插入缺失

吕志堂1,2， 王 静1， 周燕霞1， 张维维1

(1.河北大学 生命科学学院 河北省微生物多样性研究与应用实验室，河北 保定 071002；2.药物化学与分子诊断教育部重点实验室(河北大学)，河北 保定 071002)

在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析，首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失(CSIs)。23S rRNA基因具有1个98～105 nt的特征性缺失和1个5～7 nt的特征性插入，DNA复制解旋酶(DnaB)具有1个17～29 aa的特征性插入，精氨酰-tRNA合成酶(ArgRS)具有1个15 aa的特征性插入，DNA促旋酶A亚基(GyrA)具有1个27～63 aa的特征性插入。α-变形菌纲的这些CSIs使得该纲与包括变形菌门其他纲在内的其他细菌显著区分开来，为该群细菌系统发育及系统分类研究提供了可靠手段。

α-变形菌纲；保守特征性插入缺失；系统发育基因组学

α-变形菌纲(α-Proteobacteria)是变形菌门(Proteobacteria)7个纲之一，占据了包括多种陆地和海洋环境的广泛的生态位，构成了细菌域一个非常大且多样性丰富的类群[1-3]。在《伯杰氏系统细菌学手册》(第2版)中，该纲被分为7个目，即红螺菌目(Rhodospirillales)、立克次氏体菌(Rickettsiales)、红细菌目(Rhodobacterales)、鞘氨醇单胞菌目(Sphingomonadales)、柄杆菌目(Caulobacterales)、根瘤菌目(Rhizobiales)和短小盒菌目(Parvularculales)[4]。该纲细菌在形态、生理、代谢和细胞分裂机制方面呈现出极其丰富的多样性特征，与真核生物密切相关，在工业、农业和医学领域都极为重要[1,5-7]。……