刘 洋,曾全超,黄懿梅(西北农林科技大学资源环境学院,陕西 杨凌 712100)

基于 454高通量测序的黄土高原不同乔木林土壤细菌群落特征

刘 洋,曾全超,黄懿梅*(西北农林科技大学资源环境学院,陕西 杨凌 712100)

选取黄土高原不同乔木林(辽东栎, LDL;侧柏, CB;刺槐, CH;油松, YS)表层土壤为研究对象,利用第二代高通量测序技术罗氏454平台对其进行16S rRNA基因V1～V3可变区测序,通过分析其Alpha多样性、物种组成和丰度、群落结构,结合土壤的理化性质研究其对细菌群落结构的影响.结果表明：所有土壤样品共检测到36个门,84个纲,187个目.不同乔木林土壤中优势菌来自变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌(Chloroflexi)和浮霉菌门(Planctomycetes),主要的优势菌纲为放线杆菌纲(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、酸杆菌(Acidobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、浮霉菌纲(Planctomycetacia).不同乔木林土壤中绿弯菌门(Chloroflexi)与pH值呈极显著的正相关,总磷和蓝细菌(Cyanobacteria)呈极显著的正相关,微生物生物量碳与芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)呈极显著的负相关,土壤总磷含量可能为CB样地区别于其他土样群落组成的主要因素. LDL样地细菌群落受环境影响较小.

454高通量测序；子午岭；不同乔木林；土壤细菌；环境因子

土壤是一个非常复杂的环境体系,而土壤微生物是联系土壤与植物的纽带,同时土壤微生物还参与土壤中碳、氮循环,对于全球气候变化有着不忽略的影响[1-2].由于土壤微生物物种丰富、难以培养、功能多样,土壤中可培养微生物仅占到土壤整个微生物群落的 1%～10%,通过传统的纯培养方法不能准确、全面地反映土壤微……