尼罗罗非鱼不同品系间mtDNA D-loop差异分析
2016-12-17李大宇邹芝英祝璟琳
肖 炜,李大宇,邹芝英,祝璟琳,韩 珏,杨 弘
(中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室, 江苏 无锡 214081)
尼罗罗非鱼不同品系间mtDNA D-loop差异分析
肖 炜,李大宇,邹芝英,祝璟琳,韩 珏,杨 弘*
(中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室, 江苏 无锡 214081)
通过PCR扩增获得尼罗罗非鱼“88品系”(XH)、“99品系”(AN)和吉富品系(GF)3个主要养殖品系共95尾鱼的mtDNA D-loop序列,并进行碱基测序及对比分析,探究3个品系在遗传结构信息、保种现状和选育潜力的差异。 结果表明:①3个品系个体序列片段长度为550~556 bp,包括111个变异位点,其中转换、颠换、插入/缺失数依次为65、34、12,多态位点比例为18.64 %。②3个品系共有27个单倍型,XH、AN、GF单倍型数依次为12、7、10,其中GF、AN共享1个单倍型,XH、GF共享1个单倍型,其他为各品系独有。3个品系的单倍型在NJ系统树上互相交叉,GF有2个单倍型在变异水平上形成独有的进化枝。③3个品系间遗传分化指数均大于0.05,存在中等程度的遗传分化,其中XH与AN、XH与GF之间遗传漂变起主要作用,AN与GF之间基因流起主要作用。研究结果表明,目前选育的3个尼罗罗非鱼品系内遗传多样性水平较高;品系间存在中等程度的遗传分化,并具备高比例的独有单倍型, 3个品系目前仍具备较高的选育潜力。
尼罗罗非鱼;养殖品系;遗传结构;mtDNA D-loop;遗传分化
尼罗罗非鱼(Oreochromisniloticus)隶属于鲈形目(Perciformes)、丽鱼科(Cichlidae)罗非鱼属(Oreochromis),是联合国粮农组织向全世界推广养殖的优质鱼类。20世纪80年代以来,我国数次引进尼罗罗非鱼原种群体,经过多代选育改良,形成数个性状优良的养殖品系,作为罗非鱼主要养殖品系在我国南方主产区得到推广,推动了我国罗非鱼种业稳步、快速的发展。……
