海岛棉GbTCP15基因的克隆与表达分析
2016-12-17倪志勇曲延英蔡永生陈全家
郑 凯,倪志勇,曲延英,王 怡,蔡永生,陈全家
(新疆农业大学 农学院/农业生物技术重点实验室,乌鲁木齐 830052)
海岛棉GbTCP15基因的克隆与表达分析
郑 凯,倪志勇,曲延英,王 怡,蔡永生,陈全家*
(新疆农业大学 农学院/农业生物技术重点实验室,乌鲁木齐 830052)
根据陆地棉GhTCP15基因序列,设计1对引物,通过PCR技术从海岛棉品种‘新海21号’中克隆一个同源基因,命名为GbTCP15。海岛棉GbTCP15基因具有一个1 056 bp开放阅读框,编码351个氨基酸,预测分子量约为38 057.4 kD,等电点为9.01,序列中含有一个高度保守的TCP结构域。氨基酸序列对比表明,海岛棉GbTCP15蛋白与其他植物中的TCP蛋白有较高的一致性,说明该基因在进化过程中是相当保守的。亚细胞定位结果显示,GbTCP15主要分布在细胞核上,推测GbTCP15在复制和转录的过程中发挥着信号转导以及转录调控等作用。进化树分析表明,海岛棉GbTCP15基因与雷蒙德氏棉GrTCP15基因分布在同一分支上。实时荧光定量PCR表明,海岛棉GbTCP15基因在茎部和15 d纤维中表达量较高。研究表明,GbTCP15转录因子可能参与棉花纤维以及表皮毛的发育。
海岛棉;TCP;克隆;序列分析;表达分析
TCP家族是植物特有的一类转录因子,在植物中广泛存在,同时也在植物的生长发育过程中起重要作用,目前已知在拟南芥中有24个TCP转录因子[1],在水稻中有20个TCP转录因子[2]。早期发现的4个TCP基因分别为玉米(Zeamays)的TB1(teosintebranched1)、金鱼草(Antirrrhinummajus)的CYC(cycloidea),以及水稻(Oryzasativa)的PCF1和PCF2(proliferatingcellfactors1,proliferatingcellfactors2),TCP则分别来自这几个基因名称的首字母[3]。通过对这4个基因序列比较发现,序列中均含有一个由60个氨基酸组成的高度保守的区域,也叫TCP结构域(TCP domain),能够形成一个碱性-螺旋-环-螺旋的结构又称(bHLH结构域)[4]。……
