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几种豆科植物抗菌肽的生物信息学预测与分析

2016-12-03邹谋勇朱新贵

中国酿造 2016年10期
关键词:植物分析

邹谋勇,朱新贵*

(李锦记(新会)食品有限公司,广东江门529100)

几种豆科植物抗菌肽的生物信息学预测与分析

邹谋勇,朱新贵*

(李锦记(新会)食品有限公司,广东江门529100)

植物抗菌肽是存在于植物组织细胞中的一类对于对外来侵害有防御作用的小分子蛋白,可抑制或杀伤多种细菌和真菌。随着人们健康意识的提高以及技术手段的进步,植物来源抗菌肽的发掘和应用逐渐成为食品开发领域的重要研究方向。该试验从蛋白数据库中筛选了7种豆科植物的抗菌肽,并对其蛋白序列进行了比对和系统进化树分析,结合生物信息学研究工具对豆科植物抗菌肽的疏水性、拓扑结构域、蛋白空间结构和亚细胞定位进行了预测和分析。结果表明,7种豆科植物抗菌肽序列相似度达到71.94%,均具有8个半胱氨酸保守位点;豆科植物抗菌肽为碱性膜结合蛋白,分布于液泡膜、细胞核膜或者细胞膜上;其3D结构均由一组β-折叠和一个α-螺旋组成,与硫堇、植物防卫素蛋白结构相似。

豆科植物;植物抗菌肽;生物信息学;预测

抗菌肽是一种广泛存在于生物体内,对生物体相应病原体具有抑制或者杀伤效应的小分子多肽。目前已经从植物、哺乳动物、水生动物、昆虫、细菌中发现抗菌肽[1-2],并已累计发现2 000种以上[3]。近年来,对于抗菌肽的研究日益深入,特别是在食品防腐[4]和动物免疫调节[5-6]方面涌现了系列研究成果。植物抗菌肽是抗菌肽家族的重要组成部分,已报道的植物抗……

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