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鸡全基因组选择信号筛选研究进展

2016-12-02王志鹏景军红周萌

东北农业大学学报 2016年10期
关键词:信号检测方法

王志鹏,景军红,周萌

(1.农业部鸡遗传育种重点试验室,哈尔滨 150030;2.黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点试验室,哈尔滨 150030;3.东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030)

鸡全基因组选择信号筛选研究进展

王志鹏1,2,3,景军红1,2,3,周萌1,2,3

(1.农业部鸡遗传育种重点试验室,哈尔滨 150030;2.黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点试验室,哈尔滨 150030;3.东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030)

人工选择对家鸡驯化及品种形成具有重要作用,基因组上留有选择痕迹。随着基因组技术和选择信号检测方法完善,在基因组上检测选择信号成为进化生物学领域研究热点。文章主要描述选择信号定义,总结检测选择信号的重要统计方法,分析鸡基因组选择信号检测结果,以期为鸡全基因组领域研究提供参考。

鸡;基因组;选择信号

王志鹏,景军红,周萌.鸡全基因组选择信号筛选研究进展[J].东北农业大学学报,2016,47(10):100-106.

Wang Zhipeng,Jing Junhong,Zhou Meng.Genome-wide scan of selection signatures in chicken[J].Journal of Northeast Agricultural University,2016,47(10):100-106.(in Chinese with English abstract)

鸡起源于雉科原鸡属,家鸡简称Gallus domes⁃ticus。研究表明,南亚、东南亚和我国北方地区是重要家鸡起源地[1]。原鸡经长期自然选择和人工选择已产生形态迥异、各具特色的品种,主要包括蛋用型、肉用型、兼用型、观赏型、药用型等。鸡种选育历史不同,体型、外貌、羽色及生产性状方面差异显著。由于人工或自然选择干预,生物群体在世代传递过程中,某种基因型个体比例变化,基因

组上会相应留下明显特征,即选择信号。目前,利用高密度SNP标记、重测序数据等DNA的多态信息已在鸡基因组中筛选出多个存在选择信号区域。……

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