新疆南疆驴源H3N8亚型EIV NA基因序列分析
2016-11-26刘永宏张路瑶李飞赵丽
刘永宏,张路瑶,李飞,赵丽
(塔里木大学动物科学学院/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室,新疆阿拉尔 843300)
新疆南疆驴源H3N8亚型EIV NA基因序列分析
刘永宏,张路瑶,李飞,赵丽
(塔里木大学动物科学学院/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室,新疆阿拉尔 843300)
【目的】明确新疆南疆驴是否感染EIV,及EIV NA基因特征。【方法】根据GenBank登录的EIV基因序列,设计合成1对引物,针对新疆南疆地区2个驴屠宰点33份驴肺进行EIV NA基因RT-PCR扩增、电泳分析、胶回收、测序及序列分析。【结果】中国新疆南疆驴源EIV A/donkey/Xinjiang/1/2015(H3N8)株NA基因长1 413 bp,编码470个氨基酸。与国内外H3N8亚型EIV参考毒株核苷酸同源性为75.2%~99.6%,与国内外参考毒株氨基酸同源性为80%~100%,与国内毒株、哈萨克斯坦毒株和印度毒株在一个进化分支内。与GenBank数据库中唯一一个驴源毒株A/donkey/Xinjiang/5/2007(H3N8)糖基化位点个数和分布位置完全一致。【结论】新疆南疆存在驴感染EIV,可能为国内疫情的延续或周边国家传入。
驴;马流感病毒;H3N8亚型
0 引 言
【研究意义】马流行性感冒,简称马流感(Equine influenza, EI),是由马流感病毒(Equine influenza virus, EIV)引起马、驴和骡的一种高度接触性呼吸道传染病[1,2],现发现该病毒还感染犬和猪[3,4]。世界动物卫生组织OIE将其列为法定报告动物传染病,我国将其列为三类动物疫病[5]。马流感病毒属于正黏病毒科(Orthomyxoviridae)A型流感病毒属(Influenza virus A)。目前A型流感病毒根据HA分为16个亚型(H1~H16),而NA分为9个亚型(N1~N9)。从系统发育生物学角度分别对HA和NA基因的核苷酸序列及其编码的氨基酸序列进行了分析,所获结果也为上述分类提供了佐证[6]。EIV有2个亚型,分别是H7N7亚型EIV(即马甲1型)和H3N8亚型EIV(即马甲2型)[1,7,8]。……
