H1和H3亚型猪流感病毒二重TaqMan-MGB探针荧光RT-PCR检测方法的建立
2016-11-11王建华陈小金张俊哲王玉玲谭旭菲王乃福陈本龙董志珍赵祥平
王建华,陈小金,张俊哲,王玉玲,肖 妍,赵 丹,谭旭菲,王乃福,陈本龙,董志珍,赵祥平
(天津出入境检验检疫局动植物与食品检测中心,天津 300456)
H1和H3亚型猪流感病毒二重TaqMan-MGB探针荧光RT-PCR检测方法的建立
王建华,陈小金,张俊哲,王玉玲,肖妍,赵丹,谭旭菲,王乃福,陈本龙,董志珍,赵祥平
(天津出入境检验检疫局动植物与食品检测中心,天津300456)
根据H1和H3亚型猪流感病毒(SIV)血凝素(HA)编码基因的保守序列,分别设计合成特异性引物和TaqMan-MGB探针,建立了一种检测H1和H3亚型SIV的二重荧光RT-PCR方法。结果显示,该方法仅对H1和H3亚型SIV呈特异性扩增,对H9亚型SIV、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(SFV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)无交叉扩增反应;用该方法检测H1和H3亚型SIV的HA基因的 RNA标准对照(SIV-H1-RNA,SIV-H3-RNA),最适线性检测范围分别为3.7×101~3.7×108拷贝数/反应和3.4×100~3.4×108拷贝数/反应,最低检出限分别为38和34个拷贝数;该方法的组内试验和组间试验的变异系数均小于2.0%,显示其具有良好的可重复性。用该方法对520份进口猪的鼻拭子样本和78份国内猪鼻拭子样本进行SIV检测发现,进口猪鼻拭子样本的SIV检测结果均为阴性,12份国内猪鼻拭子样本的H1亚型SIV检测结果为阳性,5份国内猪鼻拭子样本的H3亚型SIV检测结果为阳性。本方法的建立为H1和H3亚型SIV检测提供了一种快速、敏感和特异的技术手段。
猪流感病毒;H1亚型;H3亚型;TaqMan探针;荧光RT-PCR
猪流感(Swine Infl uenza,SI)是由A型猪流感病毒(SIV)引起猪的一种急性、热性、高度接触性和群发性呼吸道疾病,临床上以高热、厌食、咳嗽、呼吸困难和怀孕母猪繁殖障碍为典型表现[1]。……
