藤黄微球菌rpf基因的克隆表达及其结构预测
2016-11-07张秀敏景凤霞王海强赵若玮张艳芬
张秀敏,景凤霞,王海强,赵若玮,张艳芬
(1.河北大学 生命科学学院,河北 保定 071002;2.河北大学 科学技术处,河北 保定 071002)
藤黄微球菌rpf基因的克隆表达及其结构预测
张秀敏1,景凤霞1,王海强1,赵若玮1,张艳芬2
(1.河北大学 生命科学学院,河北 保定071002;2.河北大学 科学技术处,河北 保定071002)
为了了解藤黄微球菌(Micrococcusluteus)复苏促进因子(resuscitation-promoting factor,Rpf)的性质,用自行设计的引物,以藤黄微球菌ACCC41016基因组DNA为模板,扩增rpf基因.随后,构建pET-28a(+)-rpf表达载体,在EscherichiacoliBL21(DE3)中进行IPTG诱导表达,并以克隆测得的rpf基因核酸序列为基础,对Rpf蛋白的氨基酸序列、疏水性、信号肽、磷酸化位点、三级结构以及结构功能域进行生物信息学预测分析.结果表明:该rpf基因与文献报道的藤黄微球菌IAM 14879rpf基因核苷酸序列一致性为69.72%;该rpf基因所编码蛋白的氨基酸序列与文献报道的Rpf蛋白氨基酸序列一致性为63.44%.在E.coliBL21(DE3)中成功表达了Rpf目的蛋白.初步了解了Rpf蛋白的理化性质及生物学功能.解释了Rpf蛋白能够使细菌复苏并促进其生长的理论,为进一步探讨Rpf蛋白的作用机理奠定了基础.
藤黄微球菌;复苏促进因子(Rpf);克隆;表达;结构预测
1998 年,Mukamolova等[1]从藤黄微球菌(Micrococcusluteus)的培养液中发现一种能够促进细菌复苏的物质.他们将培养液的上清液灭菌处理后,加入到处于活的非可培养状态(VBNC)的细菌培养液中,发现这些细菌能够快速复苏和生长,将培养液纯化后发现了复苏促进因子(resuscitation-promoting factor,Rpf),命名为Rpf[2].
Rpf是首次被发现的能促进休眠态的细菌复活同时促进其生长的因子,该因子是一种分泌蛋白……