APP下载

鲑鱼甲病毒阳性核酸物质制备及RT-PCR检测方法的建立

2016-10-26刘敏杜航宋傲臣高帅唐丽杰蒋烨李一经

东北农业大学学报 2016年7期
关键词:检测方法

刘敏,杜航,宋傲臣,高帅,唐丽杰,蒋烨,李一经

(1.东北农业大学动物科学与技术学院,哈尔滨 150030;2.东北农业大学动物医学学院,哈尔滨 150030)

鲑鱼甲病毒阳性核酸物质制备及RT-PCR检测方法的建立

刘敏1,杜航1,宋傲臣1,高帅1,唐丽杰2,蒋烨1,李一经2

(1.东北农业大学动物科学与技术学院,哈尔滨150030;2.东北农业大学动物医学学院,哈尔滨150030)

为建立快速检测鲑鱼甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)RT-PCR方法,根据GenBank公布的E2基因序列(1 375 bp)设计引物,扩增SAV E2全长基因,利用假病毒制备技术获得包裹E2核酸物质(RNA)的SAV假病毒溶液。以SAV假病毒作为阳性核酸物质质控品,以E2F:5'CCG-TTG-CGG-CCA-CAC-TGG-ATG 3',E2R:5'CCTCAT-AGG-TGA-TCG-ACG-GCA-G 3'为引物,优化反应条件,建立SAV的RT-PCR检测方法。结果表明,该方法可扩增SAV E2特异性516 bp的DNA片段,引物最适反应浓度为1.0 μmol·L-1,最佳退火温度为57.5℃,对SAV的三种亚型SAV1(V4640)、SAV2(V4619)、SAV5(V4638)检测结果均为阳性,对SVCV、IHNV和IPNV的PCR扩增结果均为阴性;并确定对SAV的核酸最低检出量达1.59 pg;以RT-PCR方法在不同时间对每份样品作3次重复检测,检测结果一致。表明此方法特异性强,敏感性高,稳定性和重复性较好,可用于SAV临床诊断和检测。

鲑鱼甲病毒;SAV E2;核酸物质;RT-PCR;检测方法

网络出版时间2016-7-21 14:09:34[URL]http://www.cnki.net/kcms/detail/23.1391.S.20160721.1409.004.html

刘敏,杜航,宋傲臣,等.鲑鱼甲病毒阳性核酸物质制备及RT-PCR检测方法的建立[J].东北农业大学学报,2016,47(7):56-62.

Liu Min,Du Hang,Song Aochen,et al.Positive nucleic acid material preparation and establishment of a RT-PCR for salmonid alphavirus[J].Journal of Northeast Agricultural University,2016,47(7):56-62.(in Chinese with English abstract)

鲑鱼甲病毒(Salmonid alphavirus,SAV)隶属于披膜病毒科(Togaviridae),甲病毒属(Alphavirus)[1],主要感染大西洋鲑(Salmo salar)和虹鳟(Oncorhynchus mykiss)等鲑科鱼类,引起胰腺、心肌炎症和昏睡等症状,致死率达1%~48%,在鱼类养殖各生长阶段均有爆发[2-3]。目前该病广泛流行于苏格兰、挪威、爱尔兰、法国等欧洲国家[4-6],2013年鲑鱼甲病毒感染被列入OIE水生动物疫病名录中。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

检测方法
学习方法
小波变换在PCB缺陷检测中的应用
用对方法才能瘦
四大方法 教你不再“坐以待病”!
赚钱方法
捕鱼