琼脂磁珠消减SELEX技术筛选HIV P24抗原适配体
2016-10-12葸玉琴赵运旺马梅兰曾家豫廖世奇
葸玉琴,赵运旺,马梅兰,曾家豫,廖世奇
(1.西北师范大学生命科学学院,甘肃兰州 730070;2.甘肃省医学科学研究院医学分子生物学研究中心,甘肃兰州 730050)
琼脂磁珠消减SELEX技术筛选HIV P24抗原适配体
葸玉琴1,赵运旺1,马梅兰1,曾家豫1,廖世奇2*
(1.西北师范大学生命科学学院,甘肃兰州730070;2.甘肃省医学科学研究院医学分子生物学研究中心,甘肃兰州730050)
建立以羧基化琼脂磁珠为筛选介质,快速筛选高特异性、高亲和力的HIV P24抗原适配体的方法.利用消减SELEX技术及靶标替换的方法,以HIV P24抗原作为靶分子,羧基化琼脂磁珠为载体,进行6轮筛选,筛选到3条特异性核酸适配体.特异性检测表明,筛选得到的HIV P24抗原适配体与HIV P24抗原的结合解离常数均在纳摩尔级水平.该方法为HIV早期检测提供了新的检测技术,对适配体与靶分子相互作用机理的研究具有重要价值.
HIV P24抗原;消减SELEX技术;DNA适配体;靶标替换
P24抗原是HIV-1的核心抗原,机体感染HIV-1后,P24在血清中出现的时间较早,一般在HIV-1感染后2~3周就可以检测,可作为艾滋病窗口期检测的血清标志物,通过检测血液中的P24,可达到早期诊断和治疗的目的[1].DNA适配体相比于抗体检测具有许多优点:① DNA适配体更稳定,不易降解,可长期保存[2-3];② 筛选周期一般1~2个月[4-5];③ 无免疫原性[6-7];④ 变性、复性速度较快,可反复使用[8],可在室温下运输、保存;⑤ 易于化学修饰[9].本文利用靶标替换消减SELEX技术通过6轮筛选快速得到HIV P24抗原适配体,筛选周期为10~15 d,明显地缩短了筛选周期,提高了筛选效率.
1 材料与方法
1.1实……